生于美国，在从耶鲁大学和麻省剑桥圣公会神学院毕业后，于一九一二年，作为牧师，被美国圣公会派往中国传教。随后，便在南京道胜堂作传教士。这种传教士，自一八四零年之后，便在中国出现，从此之后络绎不绝。有的人对于中国有些善意，约翰马吉便算是其中之一。
约翰马吉在南京道胜堂，一直传教到一九四零年。在一九三七年，日本人进驻南京时，约翰马吉成为国际红十字会南京委员会主席以及南京安全区国际委员会委员。而南京安全区国际委员会的主席，便是号称中国辛德勒的约翰拉贝。
约翰马吉为中国人做的最大贡献，除了在战争中救助了无数中国人，在两个月时间中给日本大使馆和日本占领军最高指挥机构写了四百多份《抗议书》和《报告书》，强烈要求停止暴行之外，便是用一台十六毫米摄影机，将日本人在南京的所作所为都拍摄了下来。并流传后世。
约翰马吉总共拍摄了四盘摄影胶片。总长度达一百零五分钟。这些镜头是留存到后世的，有关侵华日军南京大屠杀的唯一动态画面！并由其子大卫马吉，在后世二零零二年，捐献给南京大屠杀遇难同胞纪念馆，成为日本人南京大屠杀的铁证。(未完待续。)