此役，清军的损失也十分巨大，四川巡抚王遵坦落水死，马步军近七千人，尽数被杀，夔州战场上，关宁军和绿营兵损失近三万，伤者无算，杀总兵以上军官数十员，夺可用战马三万余匹，器械铠甲等无数。
吴三桂在明军挥军掩杀下，伏尸二十余里，吴三桂本人虽然逃入大山，但关宁铁骑基本已经被打惨，明军剪除了一支威胁巨大的骑兵，将有利于明清攻守之势的逆转!
此战之后，川蜀之地，清军兵力被大大削弱，川东、川南的清兵都开始向成都平原收缩，受此消息的激励，藏身在蜀地大山中的各路义军闻风而起，川蜀大震。
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