所被踏成废墟。
他只是喃喃自语，“我知道这一刻终究会来临，虽然我并不明白为何会如此……”
大木博士确实一无所知，除了“这一刻终究会来临”。
必须要阻止笔直前行的霸王龙化石……
精灵和人类，都本能地试图让化石停下。
不停止霸王龙的化石，这个拥有精灵的世界其存在本身就将面临危机。
连面临危机的理由都模糊不清，只是本能地这么感觉。
前行路上，上演着各式各样人类与精灵的活剧。
只是，霸王龙化石依旧笔直前行。
挺身而出试图阻挡化石的精灵与人类。
追赶着前行的化石试图阻挡的小智一行，以及火箭队三人组。
前行路上，有火箭队的秘密基地。火箭队本队也积极展开阻挡化石的行动。
这一刻，不分敌我。
为了阻挡霸王龙的化石，使出浑身解数。
能保持冷静的，也只有信仰“自我存在”的超梦之流。
终于，霸王龙的化石停了下来，在它停下的地方……
故事嘎然而止。
动物究竟是什么？
人类究竟是什么？
去思考他们的区别与相似，答案并不难找到。
就算不借助口袋电影，也能表达的主题。
这就是幻之口袋剧场版3的构想。
电影的主体是“自己生存的世界究竟是什么”
首藤为这个脚本足足构想了半年。他想了许多理由来应付诸如“这么复杂的东西拿出来搞坏世界观怎么办”之类的反论。
可出乎他意料的，阻止霸王龙化石前行的，并非有关世界观的责难，而是制作人一句简简单单的“让无机质物动起来的电影不卖座”。
霸王龙的化石最终未能登上银幕，取而代之的是大家熟知的《结晶塔之帝王》，这也是首藤刚志最后一部口袋电影。
最终话
斯巴达克起义－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－－〉stand
byme
“自我存在”，“共存”，“生存的世界”。
首藤在对精灵的不断思索中，体力和精力早已严重透支。
他有想过剧场版4，却什么也想不出。
在他脑海中唯一想定的，只有那永远不会实现，却可以真正意义上彻底完结整部系列的，口袋动画最终章。
故事从精灵们引发起义开始。
就像罗马时代的斯巴达克起义一样，精灵们发现自己看起来像是被当作朋友对待，实际一直都在充当人类的奴隶。于是它们发动起义，而起义军首领，正是那不愿呆在人类制造的精灵球中，个性强烈的小智的皮卡丘。
在动画末期，皮卡丘已经具备足够强大的力量。
强到就像罗马时代将罗马逼入绝境的角斗士斯巴达克。
小智与皮卡丘依然没有忘却过去的友情。皮卡丘是应该选择作为精灵独立？还是和异种类生物的人类一起，坚信情感与友情，寻求共存之路？
小智和皮卡丘苦恼不已。
“但是人类和精灵是可以共存的”
这时站出来的，是为了阻止这场战争而大肆活跃的火箭队三人组。
他们激励那些无能的精灵，凭借喵喵奇奇怪怪的翻译行走战场。而且，喵喵会学习人类语言，也正是因为他为了博得心上猫的欢心，而励志成为人类的结果。（71话「喵喵的ABCDE」，这一话正是原定最终话的铺垫。）
火箭队三人组是精灵与人类共存的典范。
除去他们，还有那面对“自我存在的提问”，自己是精灵？是人类？还是克隆？寻找到答案的超梦。
无论对方是精灵，是克隆，还是尚未接触的什么，只要自我的存在不灭，我们便可以和任何事物共存。
这还不是结局。
口袋世界是什么？
什么是口袋世界？
答案，早在冒险的开始便已阐明。
当游戏主角走下楼梯，打开电视，电视里显现的是4个行走在铁轨上的少年。
standbyme，《伴我同行》，1986年的美国电影，讲述一个作家成年后回忆儿时某个夏天与伙伴们寻找传说中的尸体的冒险故事。听信流言而踏上旅途，在大人眼中是如此荒唐无稽的，可在少年眼中，却是一场跌宕起伏的大冒险。
尾声
岁月飞逝，已是年迈老人的小智，回想自己的往昔。
那是被美化的少年时代的回忆。空想……，与想象的生物口袋怪兽的冒险。友情。共存。
那是活在现实世界的小智儿时未能邂逅的东西。然而，在少年时代的某处，皮卡丘和精灵们确实就在那里，武藏，小次郎，超梦也都在那里……不只如此，小智少年时代经历的全部冒险，都在老人小智眼前一一闪现。