他无法参加2006年世界男子篮球锦标赛。
他自己曾说：“24号的意义就是24小时，我希望把自己的所有精力都投入到篮球当中，这就是我选择24号的原因。如果不能全身心认真投入，我就不是科比。24是我的最佳诠释。”
第二次获得NBA全明星赛最有价值球员奖。整个赛季，科比卷入了一系列的球场事故之中。
1月28日，科比在投出一记可能制胜的跳投后，手肘打在了马刺队后卫马努·吉诺比利的面部。
经过联盟的重新审查，科比被禁止参加随后在麦迪逊广场花园与纽约尼克斯队的比赛。这次禁赛的依据则是科比向后挥动手臂是“一个反常的动作”。
之后，在3月6日，他好像又重复了这样的动作，而这一次打到了明尼苏达森林狼队后卫马科·贾里奇。
3月7日，NBA给科比开出了第二次禁赛一场的罚单。
3月9日，在他回归的第一场比赛中，他又肘击到凯尔·科沃尔的面部，赛后该行为被追加为一级恶意犯规。
3月16日，科比在主场对阵开拓者队的比赛中得到赛季最高的65分，帮助湖人队结束了7连败。这是他11年职业生涯第二好的得分表演。
接下来的一场比赛，对阵森林狼队科比得到50分，之后一场比赛，科比在战胜孟菲斯灰熊队的比赛中得到60分—成为第二位连续3场取得50+得分的湖人球员，也是继1987年迈克尔·乔丹后第二次有这样的表演。
另一位可以做到这样的湖人球员是埃尔金·贝勒，他在1962年12月连续三场得到50+。
第二天，在一场对阵新奥尔良黄蜂队的比赛中，科比得到50分，成为继张伯伦之后NBA历史上第二位取得连续4场50+得分的球员，连续50+场次最多的纪录是张伯伦创造的7场。
赛季结束，科比总共拿到10次50+，成为继张伯伦在1961-62和1962-63赛季后唯一能在单赛季做到此的球员他还连续第二年获得了得分王头衔。
在2007年季后赛中，湖人队再次在季后赛第一轮以1-4输给了太阳队。
MVP
2007年12月23日，科比在麦迪逊广场花园对阵纽约尼克斯队的比赛中成为史上最年轻的达到20000分的球员（29岁122天）。
尽管在2008年2月5日的比赛中右手小拇指韧带撕裂，科比并没有选择手术，而是打满了常规赛的82场比赛。谈及他的伤势，科比说道，“我更喜欢在湖人赛季结束或今夏北京奥运会后再进行手术。现在我和队医必须继续每日观察我的伤情”。
科比带领球队打出西部最佳的57-25的成绩，在第一轮横扫丹佛掘金队。
2008年5月6日，官方正式宣布科比荣获NBA最有价值球员奖，是他职业生涯的第一次。他说道，“这真是一次漫长的旅途。我很自豪能够代表这支球队，代表这座城市。”
将科比带到湖人队的杰里·韦斯特也出席了科比接受MVP奖杯的新闻发布会。他说，“科比配得上这座奖杯。他只是又打出了一个伟大的赛季。我一点也不惊讶。”
除了获得MVP奖项之外，在5月8日，科比还是唯一一名全票入选NBA最佳阵容的球员，这是他连续第三年入选第一阵容，职业生涯第六次。
之后，他又与凯文·加内特领衔NBA最佳防守阵容第一阵容，科比总共获得52分包括24张第一名选票，这是他第八次入选。
湖人队以西部第一名进入季后赛，首轮对手是掘金队。第一场比赛中，大部分时间作为诱饵的科比在比赛的最后8分钟拿到了他32分中的18分，确保湖人队保持领先。
湖人队在首轮4-0击败掘金队，使掘金成为自2004年灰熊队被马刺队首轮横扫后第一支获得50胜的球队在首轮被横扫。
在第二轮对阵爵士队的第一场比赛中，科比得到38分帮助湖人击败爵士。湖人同样赢下了第二场比赛，但是输掉了第3和第4场比赛，虽然科比场均可以得到33。5分。
湖人赢下了接下来的两场比赛，用6场比赛赢下了西部半决赛。湖人在西部决赛的对手是马刺队。湖人队用5场比赛击败了马刺队，闯进NBA总决赛对阵波士顿凯尔特人队。
这是科比生涯第5次，也是第1次在没有奥尼尔的情况下进入总决赛。
最后湖人队在6场比赛后输给了波士顿凯尔特人队。