短暂的低潮
在2002-03赛季，科比场均可以得到30分并且完成了连续9场比赛拿到40+，整个2月份场均得到40。6分。
另外，他还能场均贡献6。9个篮板，5。9次助攻和2。2次抢断，均为生涯新高。科比再一次同时入选NBA最佳阵容和最佳防守阵容的第一阵容，在MVP的票选中排名第三。
在常规赛取得50胜32负之后，湖人队在季后赛西部半决赛6场比赛后输给了当年最终的总冠军圣安东尼奥马刺队。
接下来的2003-04赛季，湖人队获得了全明星球员卡尔·马龙和加里·佩顿，再次冲击总冠军。
在赛季开始前，科比因为性侵犯指控被捕。这导致了科比因为出庭缺席了一些比赛；或是某天的早些时候出庭，在同一天的晚些时候赶去参加比赛。
在常规赛的最后一场比赛，湖人队对阵开拓者队。科比用两次绝杀带领湖人取胜，并赢得了太平洋赛区的冠军。在第四节的最后时刻，科比投中三分球扳平比分，将比赛拖入加时赛。比赛最后进入了第二个加时，科比又投中压哨三分帮助湖人105-104获得了胜利。
拥有四名未来篮球名人堂球员，奥尼尔、马龙、佩顿和布莱恩特，湖人队最终杀入NBA总决赛。
在总决赛中，湖人队被底特律活塞队在5场比赛中击败，后者自1990年第一次获得总冠军。总决赛系列赛中，科比场均贡献22。6分，还有4。4次助攻，命中率只有可怜的35。1%。
菲尔·杰克逊没有与湖人队续签合同，接替他教练职务的是鲁迪·汤姆贾诺维奇。奥尼尔被交易至迈阿密热火队，换来了拉玛尔·奥多姆、卡隆·巴特勒、布莱恩·格兰特。
第二天，科比拒绝了洛杉矶快船队提供的合约，与湖人队续签了一份长达7年价值1亿3640万美元的合同。
2005-06赛季是科比篮球生涯的转折点。尽管之前与科比有分歧，菲尔·杰克逊还是选择重回湖人执教。[74]科比对此举动表示赞同，各种表现证明，这二位的第二次合作还不错，带领湖人队重新回到了季后赛。科比的个人得分数据也是其职业生涯中最好的一个赛季。
在2005年12月20日湖人vs达拉斯小牛队的比赛中，科比在前三节比赛中独得62分（第四节未出场），在他下场时个人得分62分竟比小牛全队61分的得分还高，科比是自24秒计时器引入以来的第一位做到此的球员。
2006年1月16日，湖人队面对热火队，科比与奥尼尔在赛前的握手和拥抱成为了当日的头条，标志着这两名球员之间的矛盾逐渐发生改变。
一个月之后的2006年NBA全明星赛上，这两个人被看到在一起说笑。2006年1月22日，在对阵多伦多猛龙队的比赛中科比得到了职业生涯新高的81分。
除了打破之前由埃尔金·贝勒创造的71分的纪录，科比单场81分还是NBA历史上单场第二高分，仅次于威尔特·张伯伦于1962年创造的单场100分纪录。
在同一个月内，科比还成为了自1964年以来第一位连续4场比赛得到45分或更多得分的球员，成为继张伯伦与贝勒后第三位可以做到此的球员。
整个1月份，科比场均可以得到43。4分，排在NBA历史单月场均得分第8位，以及除张伯伦外个人单月场均得分第一位。2005-06赛季结束时，科比创造了湖人队史单赛季取得40+场次最多的纪录以及最多得分的纪录。
科比凭借场均35。4的得分第一次获得了联盟得分王的头衔。
在2006年NBA最有价值球员奖评选中排名第四，但他获得了22张第一名的选票--仅次于最后的胜者史蒂夫·纳什。湖人队打出了45胜37负的常规赛战绩，比前一个赛季多赢了11场。
8号→24号该赛季的晚些时候，有报道称科比将从2006-07赛季开始改变自己的球衣号码，从8号改为24号。他在高中的第一件球衣就是24号，之后改穿33号。
科比在TNT电台采访时说，他曾打算在新秀赛季选择24号，但是无法实现，而33号球衣已经随同卡里姆·阿布杜尔-贾巴尔退役了。
科比曾在AdidasABCD训练营身穿143号，所以最后选择了三个数字之和8作为自己的号码。在季后赛第一轮，湖人队做得足够出色，他们在系列赛中以3-1领先菲尼克斯太阳队，其中第4场比赛凭借科比投入的两记关键球击败了对手。
在第6场比赛中，他们仅差6秒就可以将二号种子太阳队淘汰出局，但是最终还是在加时赛中以118-126输掉了比赛。
尽管科比在系列赛中场均可以得到27。9分，但是湖人最终在7场大战中输给了太阳。在第7场90-121负于太阳的比赛中，科比因为在下半场仅有3次出手而受到指责。
在2006年的休赛期，科比进行了膝盖手术，使得