经不像过去那样具有动力继续当一个篮球运动员了“。尽管第二次退役后乔丹有整整三个赛季没有打球，他依然是当时世界上最广为人知的运动员。01-02赛季初，乔丹捐了1百万美元帮助那些911事件的受害者。
在2000年做为华盛顿奇才队股东和球队运营经理一职后，由于对球队表现的不满，他又一次回到他所钟爱的运动中来。2001年9月25日，时任奇才球队主席的乔丹走出了他的办公室，以老将底薪与奇才队签了两年合约，并带来了他在公牛的老教练DougCollins，希望能把这只队伍拉出烂队的沼泽。虽然由于年岁的增长，他的身体已是大不如前，而且受到伤痛的折磨，他还是能够拿下了场均几乎23分。带着伤痛（尤其是膝伤），他依然是球队重要的一员。可惜虽然奇才获得了争夺季后赛门票的资格，却两年都没有闯入季后赛。但是乔丹还是留下了不少伟大的瞬间，比如02-03赛季时刚过40岁的他拿下43分的高分。
乔丹在02-03赛季穿着特殊设计，能减轻膝盖压力的球鞋健康的回到了场上，场均得到20分。那一年，他参加了他的最后一届全明星赛；赛季结束后，他第三次也是最后一次和球迷们说了再见。费城之战是乔丹生涯的最后一战，03年4月16日乔丹在有限的上场时间里拿下15分，但是没能帮助奇才最终获胜。最后1。44秒，乔丹投入他最后的两粒罚球后被替换下场，全场热烈鼓掌长达3分钟。
出于对乔丹的尊敬，尽管他从没为佛罗里达的球队效力，迈阿密热队在03年4月11号还是退休了他的23号球衣，这是迈阿密热队15年队史中第一次球衣退役。那件衣服半边是奇才蓝另一边是公牛红。
04-05赛季，没有乔丹的奇才杀出重围，进军季后赛。第一轮灭了公牛队，第二轮以横扫的结局被热队踢出了季后赛。
球王转型
他以一个球员的身份离开了球场回归了管理层，他看着这些年轻的巨星们，确信NBA运作良好。在他的书《我所深爱的运动：我的故事》中，他这样写道：“这个世界上没有所谓完美的篮球运动员，我从来也不相信有一个最伟大的球员；每个人身处不同的时代，我站在前人的肩膀上贡献出我自己的才华。我相信，“伟大“是一个时期一个时期不断进化的过程。没有朱利叶斯·欧文，，瓦尔特·戴维斯，和埃尔金·贝勒，就不会有迈克尔·乔丹。我从他们那里进化而来“。
乔丹很喜欢证明他的反对者错了。在某场对阵犹他爵士的比赛中，乔丹在约翰·斯托克顿头上灌了一个篮，一个爵士球迷喊道“有本事灌个大个的！“下一个回合，乔丹在6尺11寸，285磅的中锋MelvinTurpin头上灌了一个，接着问那个球迷，“这个够大了吧?“
2010年3月19日，乔丹此次动用了2。75亿美金完成了对山猫的收购，不但让自己成为了史上第一个退役球员身份的老板，也是联盟历史上第二位黑人老板。
技术特点
伟大人物的共同特征是具有创造性。乔丹能征服人心的是他那出神入化、令人叹为观止的球技。乔丹认为篮球是一项要求人具有全面能力的运动，特别是想像力和创造性。NBA当初有一种说法：“地板属于‘魔术师’约翰逊，空中属于迈克尔·乔丹。”
乔丹身高1。98米，这在巨人如林的NBA，顶多算是个中等身材。但乔丹的身体素质具有异于常人的地方，他身体肌肉中的脂肪比重只占3%，通常脂肪占5%就被誉为运动天才，这也就不难解释为何乔丹最怕游泳。经过测验，乔丹的百米速度是10秒5，跳远成绩为7。5米以上，立定可跳起120厘米、助跑则在150厘米以上。当他需要显示弹跳和力量的时候，他可以跳到2米以上的巨人的肩膀上，并隔着两个人大力灌篮；当他需要显示飞行的时候，他可以从罚球线起跳把球塞入篮框——历史上只有三个人能进行这种表演，但惟有他轻松而舒展。
当他想娱乐观众的时候，他可以在空中跨步、转体，在空中览尽风光之后用各种花样扣篮。美国人喜欢看扣篮，而乔丹在1987年、1988年连夺两次花球扣篮大赛的冠军。他空中的姿态无与伦比！乔丹自己最得意的还是他的空中躲闪和滞留技巧。“魔术师”约翰逊说：“乔丹跟你一块跳起来，他会把球放在腹下，等你落地了，他再投篮。”
这是他的一个绝活。更绝的是，他可以在空中任意改变方向，把防守者引诱到这边来封阻，而他却突然把球转到那一边上篮，“就像在林子里飞翔的小鸟，他跟你捉迷藏，把你耍够了之后，他再心满意足地上篮得分”。乔丹球技的另一个体现是全面。开始的时候他偏爱篮下进攻，而他中投一向准确也是出名的。
后来针对他的防守(通常是两个人)越来越强悍，乔丹有意识地训练了自己的远投，使其三分线外命中率达到30%。人们将乔丹的成功秘诀归为十点：好胜心，职业态度，无与伦比的身体控制能力，和谐的力量，惊人的速度，弹跳能力，持久的耐力，过人的