日本得知中俄协定草案的内容以后，立即向大清表示：“此次议款，中国万不可割地。www.DU00.COm如允割地与一国，或虽未明割而允其设官置兵，亦是暗让。一经允定，他国必群起效尤。”随后，日本相当强硬地照会俄国：某些条款“侵犯了中国的主权和领土完整，也侵犯了其他列强的某些条约权利”，要求俄国更改协定！
日本为什么突然对俄国这么强硬呢？有两个原因：一是当联军攻打天津、北京的时候，日军亲眼目睹了俄军的战斗力，发现俄军不过如此；二是俄国的野心太大，威胁到英国在远东的支配地位，愿意支持日本同俄国作战以达到限制俄国进一步扩张的目的。
俄国虽然看不起日本，但是也意识到日本已经今非昔比，如果发生战争的话俄国绝不会完胜，必定会受到较大损失。因此，俄国准备再放弃一些自己在朝鲜的利益以换取日本在俄国占领满洲问题上保持沉默。
俄国主动示弱，日本也乐得接受，打算和俄国共同商议朝鲜和满洲问题。这次轮到英国着急了。如果日俄两国把朝鲜、满洲瓜分了，英国这个世界老大的面子往哪里搁？照这样下去，以后远东就是日本和俄国的天下了，英国迟早被赶跑！另外，俄国如果在远东地区过于顺风顺水的话就极有可能联合德国在欧洲给英国制造麻烦！这才是英国最担心的！英国期望日本能够将俄国拖在远东这个泥潭中无暇他顾，所以他向日本表示：俄国入侵满洲损害了大清的主权和领土完整，影响了远东的和平与稳定，英国愿意和日本结盟，共同对抗俄国。
俄国、英国同时向日本伸出了橄榄枝，日本会选择谁呢？
迟钝的日本人没能理解英国的战略企图，他们怀疑英国可能遇到了什么难处，想借助结盟来利用日本！伊藤博文认为“英国政府只图一己之利，不顾其它，与之联合，收效甚微”，不愿意和英国结盟，更倾向于和俄国媾和。而首相桂太郎则认为俄国非常奸诈，出了名的不讲信用，不愿意同俄国媾和，更倾向于和英国结盟。
既然双方的意见不统一，所以最终与哪个国家结盟还得看谁提出的条件更诱人。日本人问俄国人：我想独占朝鲜，可以吗？俄国人答复：我承认你在朝鲜的优势地位，但是你不能独占朝鲜。一贯奸诈的俄国人这次很实诚，竟然忘记忽悠日本人，真是出乎意料。日本人又问英国人：如果我和俄国开战，你到底能帮上多大忙呢？英国人答复：我将严守中立，但是如果有第三国帮助俄国打你的话，我也会帮你打他；而且如果你军费不够用的话可以找我贷款。
日本高层最终达成共识，即：与他国签订的条约只有在本国具备使对方遵守条约的实力时才能成立，因为俄国比日本强大，即使同他结盟也不能保证日本永久牢固地独占朝鲜。所以，还是选择英国吧。
1902年1月30日，日本和英国签订《日英同盟协约》。这意味着如果俄国再不从满洲撤军的话，英国将支持日本对俄国开战！何况八国联军中的其他七个国家都已经于去年8月全部撤军，俄国人再不撤军实在说不过去了，人不能无耻到这种地步！4月8日，俄国和大清签订《交收东三省条约》，承诺6个月之内撤出盛京省的驻军，12月之内撤出吉林省的驻军，18个月之内撤出黑龙江省的驻军。
日英同盟不战而屈人之兵，逼着俄国人列出了从满洲撤军的时间表，笼罩在满洲上空的战争阴影烟消云散。英国人对于这种结果并不是很满意，他的计划是让日本和俄国进行一场战争，逼迫俄国将主要精力放到远东而无暇顾及欧洲。没想到俄国这么经不住吓唬，轻易就答应撤军了！
不过英国人错误估计了俄国人的道德水准。俄国人说要撤军并不代表他真的会撤军！1903年4月，俄国人突然向大清提出条件：天气不好，部队调动不便，我要暂停撤军。如果非得让我撤军的话也可以，你必须保证不将满洲割让或者租借给其他国家！并且不能把满洲的任何城市向其他国家开放！
真是流氓无赖！满洲是大清的，大清愿意租借给谁就租借给谁，愿意向谁开放就向谁开放，你凭什么要求大清向你做出保证？再者说，即使大清保证不将满洲割让或租借给其他国家，以你一贯出尔反尔的作风，你也不会撤军的！所以，大清绝不会向俄国做出这种毫无原则的保证。
然而日本还是担心大清一时糊涂向俄国人做出承诺，那样的话日本将来侵略满洲的时候俄国就有借口出兵干预了！所以日本赶紧警告大清：千万不要答应俄国人的请求！如果答应的话满洲就成了俄国人的了！英国和美国也向俄国提出抗议，要求俄国放弃自己的无理要求。
4月26日，桂太郎、伊藤博文、山县有朋和小村寿太郎进行秘密会议，决定就满洲撤军问题和俄国进行谈判并乘机解决朝鲜问题。
7月28日开始，日本和俄国就朝鲜、满洲问题进行了为期半年的谈判。在谈判过程中，日本的底线是独占朝鲜，然后