，定远开始慢慢倾斜、下沉。定远舰管带刘步蟾急令砍断铁锚，将巨舰驶向浅滩，主动搁浅，将巨舰从死亡边缘拉了回来。然而定远舰由于受创过于严重，难以修复，已经失去了战斗力。刘步蟾悲愤难忍，向丁汝昌求一死以谢渎职之罪，丁汝昌赶紧宽慰他说：“此乃我之罪也，切莫存有此念！”
5日上午8时，伊东右亨从望远镜中看到定远舰搁浅，清军水兵从定远舰往下方的汽艇搬运物品，立即明白定远舰失去了战斗力。联合舰队趁机发动攻击，22艘战舰在威海港外一字排开，炮轰港内舰船。北洋舰队依托刘公岛炮台、日岛炮台予以还击。双方炮战良久，互有损伤，联合舰队仍未能攻入港内。
6日凌晨，伊东右亨故技重施，再次派5艘鱼雷艇夜袭北洋舰队。日本人非常注重细节，他们这一次行动的时间是4时，比上一次晚一个小时。当北洋舰队的官兵等到凌晨3时认为日本人不会再来偷袭而放松警惕的时候，日军鱼雷艇又偷偷溜了进来，击沉了巡洋舰来远和练习舰威远。下午，联合舰队再次发起炮战。北洋舰队的十艘主力战舰只剩下镇远、靖远、济远以及国产的平远四艘能够继续作战，虽然全体将士奋力抵抗，但是炮火已不再如往日那般猛烈。