消息传入了他的耳中——织田信雄与羽柴秀吉单独议和了，愤怒的成政决定亲去浜松城请求信雄、家康二人继续作战。11月13ri，正值严冬，成政抱着必死的觉悟率领家臣30余人（一说百余人）通过常愿寺川、芦峅寺、弥陀原、松尾峠、汤川谷，然后穿过狮子岳和鹫岳之间的佐良峠，经由五se原再翻越针之峠进入大町。这条路线是一条通往东海方向最短距离的“盐道”，非冬季节是一条连接北陆和东海地方的商道，但从没有人在冬季大雪封山的时候使用这条“盐道”。最后，成政等人通过诹访，于12月25ri到达德川家康的浜松城，这便是被后人津津乐道的“さらさら越え”（大穿越？）。从北陆到东海，成政一行并不是盲目的横越山区，他们由jing通当地地理的芦峅寺僧人协助，判断气候、制定周密的行进计划。然而，更令人叹服的是成政本人的勇气，能忍受零下二、三十度的严寒向渺无人烟的深山挺进。在当时，严冬季节的八山八谷以北被人们传言居住着妖魔鬼怪，因此无人敢在冬季进入山区。不仅如此，群山本身也存在很多危险，山区内的积雪通常厚达18－20cm，雪崩也经常发生。“さらさら越え”是ri本集体登山史上的最早纪录，成政等人也被视为集体登山的先驱。
经历了艰难险阻终于到达了目的地，可是成政却没有得到等价的回报，家康也于12月与秀吉议和、交换了人质。议和后的家康已经无意再战，成政无奈之下，只能再次翻越群山回到越中。成政完全被孤立了，可是他并没有就此放弃，仍然在为来年的战斗积极准备着。（另一种说法是，成政此时已经意冷心灰，打算与秀吉议和，不过众家臣坚持再战。）
翌年，天正13年（1585），成政与利家之间的对决再次展开，不过这一年中，佐佐方攻势锐减，双方在加越国境展开拉锯战。2月，前田军首先发动攻势，进攻越中砺波郡莲沼城；3月，佐佐军作为还击，袭击加贺石川郡鹰巢城；4月，前田军进攻佐佐方鸟越城。4月14ri，接受前田方调略的阿尾城主菊池武胜倒戈，恼羞成怒的成政命令神保氏张夺回阿尾城。6月24ri，阿尾合战，神保氏张、氏则父子率五千军势与前田庆次率领的两千军势发生激战，最后神保军兵败撤退。
7月间，成政通过家康向秀吉转达自己的降伏之意，被秀吉拒绝了。不得已，成政只好加强领内防御工事的修筑，以示对抗决心。8月，平定了四国的秀吉接受利家的请求，开始越中平定，十万大军从加贺出阵。兵临城下，自知毫无胜算的成政通过织田信雄再次转达了自己的降伏意愿。25ri，秀吉同意了成政的降伏请求，不过要求成政切腹，在前田利家和织田信雄（还算有点良心）的恳求下，秀吉方才宽恕成政。最后，成政被没收越中一国，其领地只剩下新川郡。
降伏后的成政离开富山城，随秀吉进入大阪，然后成政被给予摄津国能势郡一万石的封地。成政的降伏，标志着信长谱代众中的反秀吉派被完全消灭。在一系列巩固自身政权的措施出台后，秀吉入侵朝鲜和大明国的计划浮出水面，而侵略朝鲜，就必须征服九州地方。正在这时，九州丰后国的大友家因为被岛津家攻打，向秀吉请求援助。秀吉借这个机会，开始了九州攻略。
成政的最后
天正15年（1587），秀吉统领20万大军从大阪出发，开始九州征讨战，佐佐成政率领小姓组五百人随军出阵。秀吉直属军势共1万4千人，分为前备军、胁备军、后备军和小姓组（一说成政所率小姓组隶属于羽柴秀长部）。小姓组中除了成政，还有织田信雄、蜂屋赖隆等活跃于信长时期的武将，与其称作“小姓组”，不如称为“亲织田军”更合适。秀吉本阵军势从丰前小仓进入九州地方，经筑前、筑后、肥后隈本南下萨摩川设阵，沿途原本依附岛津家的地方豪族纷纷归降。大军压境之际，岛津义久将家督位让与弟弟义弘，在成政等人的游说下，岛津家向秀吉表示臣服。九州征讨战结束，秀吉用了短短几个月的时间就统一了九州地方。
在回师大阪的途中，秀吉任命成政为肥后国主，入隈本城；原隈本城主城久基前往大阪待命。另外，秀吉把小早川隆景、黑田如水和森吉成等人都分封在九州。
成政虽然被提拔为一国大名，但是对于肥后其他国人众，秀吉则保留了他们的领地。肥后的城主（国人众）共有52人，他们之间因为血缘关系而团结一致，各自du li统治着自己的领地，并不是完全隶属于秀吉，就如他们在战国时期一样，在du li自治的基础条件上，哪方的势力较强就投靠哪方。而秀吉此时已经计划侵略朝鲜和大明，希望国内的战乱能早ri结束，更重要的是，秀吉的构想是从博多津派遣军队入侵朝鲜半岛，肥后则成为了重要的后方补给基地。出于这些打算，秀吉对肥后国内的实际割据局面只是睁一只眼闭一只眼。这也是引起后来“肥后国人一揆”的根本原因之一。
鉴于肥后国的特殊地位，秀吉给成政下达了5条“制书”（统治方针）：
一、按照秀吉的决定发放给肥后国人知行