义两年间县旧隶五百余村俱残破，仅存东里、蔡王二堡。还有其他一些记录，都是人口锐减，当然也并非全是因此，当年又逢大旱饥荒，瘟疫横行。
也有人也论，回民起义之初，主要是回汉民之间的矛盾，经常有械斗。借清朝军队集中到南方对付太平天国和云南回民起义，关中地区防务空虚，一些回民领屠杀汉民报私仇。
当时七成汉民抽大烟，身心俱病，一盘散沙，无力抵抗，而回民不抽大烟，又习武，心齐。这些不在事之地，都不敢妄谈。只谈事实在眼前。
实际这种事情一经激化，那是愈演愈烈，难以回头。起义军又何尝不苦，拖儿带女被追着四下流窜，
天寒地冻的，妇女浑身冰冷，冻得孩子都吸不出奶来，也是很多妇幼病残死在路上。
据镇原县志：四乡堡寨攻陷无遗，而县城独全，盖四乡之人逃出虎口者，生后入城避难。是月初九日，全城糜烂，死者不知其数。
《甘肃新通志》记，同治二年八月，回民军队陷平凉城府官……员死节者百余，士民死者十数万。陷宁夏府城，汉民十余万被屠殆尽.
华亭县，据记载，同治二年十一月，陕回入境，焚杀极惨。初土回叛变，尚爱乡土，不甚残毒。及陕回入境，无所顾惜，焚杀惨于土回十倍。华亭从此丘墟。
陕回入甘经渭源、狄道至河州，屠杀甚惨。由于当时农村杀得很惨，能逃的则涌入县城，借城墙保命。然而城破之后，则被血洗。如渭源城破后，屠毒生灵以数万计，满城官员皆死之。
另一记载：残杀一日，辄死人民数万，血流成渠，尸积如山，伤心惨目。
隆德县。据载：同治四年县破城，从此官逃庄浪，城空无主者五年．人民杀毙饿死十有**，老弱逃尽，全县无二三十人家。全县村村焦土，十室九空．
后有歌辞同治五年三月间，杀气弥漫天。十余万人一朝尽，问谁不心酸。
尽罹锋镝，天降鞠凶,这才刚刚开始。