次起义包括多次的李弘起义严加斥责。称他们是‘父不慈、子不孝、臣不忠‘的‘愚人‘和‘恶人‘犯了亵渎太上老君、叛逆君父的大罪‘当疫毒临之恶人死尽‘。
表示坚决制止同类事件的继续生为此要‘以礼度为‘即用儒家礼法改造天师道用臣忠子孝的原则充实它的戒律使之完全符合封建制度的需要。其次要‘除去三张伪法租米钱税及男女合气之术。‘还要整顿组织加强科律等。经过寇谦之整顿、改造后的天师道史称北天师道。南朝宋道士6修静在南方也对天师道实行了整顿和改造据《6先生道门科略》记载其重点是组织整顿。提出整顿二十四治健全‘三会日‘和‘宅箓‘制度以及严格实行道官按功升迁制度等。经过6修静整顿改造后的天师道史称南天师道。
天师道在南北朝经过寇、6二人的整顿和改造后生了重大变化。主要是摒除原来它所包容的某些反映下层群众要求、有违封建礼制的成分增添了儒家伦理纲常的内容使它由一个民间宗教变成符合封建统治阶级需要的士族宗教。
与此同时其组织得到相应的整顿教规、教仪得到一定充实。自此以后天师道进入一个新的历史时期。
经寇谦之改革后的北天师道得到北魏统治者的大力支持在北魏境内大为兴盛。《魏书-释老志》载：太武帝‘崇奉天师显扬新法宣布天下道业大行‘并‘起天师道场于京城之东南重坛五层遵其新经之制。给道士百二十人衣食斋肃祈请六时礼拜月设厨会数千人‘。太延六年（44o）太武帝听从寇谦之建议改元太平真君。三年（442）太武帝‘亲至道坛受符箓‘。此后北魏历代皇帝即位时都至道坛受符箓成为定制。太和十五年（491）秋孝文帝元宏因京城‘里宅栉比人神猥凑‘下令将原在城内的道坛迁至南郊。六世纪中期北魏分裂为西魏、东魏分别迁都洛阳和邺城各将天师道场迁至新都崇奉天师道如故。不久高氏取代东魏建北齐字文氏取代西魏建北周。天师道在北齐曾一度遭取缔但在北周却继续受到支持。
经6修静改造后的南天师道亦有相当展。主要表现是两晋时期天师世家的子孙仍继续奉道。如杜子恭的玄孙杜京产及子栖仍‘世传五斗米道不替‘。《南齐书-高逸传》载：
‘京产少恬静闭意荣宦颇涉文义专修黄老。‘《南史-隐逸上》称其子杜栖亦续奉天师道至于萧梁之世。另一天师道世家会稽孔氏至孔灵产时继续奉道他在宋明帝泰始中罢晋安太守后有隐遁之怀‘宋明帝于禹穴之侧立怀仙馆诏使居焉。‘此外南郡枝江人刘凝之于宋文帝元嘉（424～453）年间‘居衡山之阳采药服食受天师化民之道‘而‘王公赠遗一无所受‘。
隋统一全国后南北天师道合而为一。但直至唐代史书缺乏记载情况不明。唐代中后期张陵子孙在江西龙虎山续传天师道逐渐形成传播中心世称龙虎宗。从此结束其早期展历史而进入新的展阶段。