参谋、军需、执法、军械、政务、教育、交际、副官（又称承启处）。参谋处下分五课：海军、交通、印刷、铁道、河川。政务处下亦设五科：机要、外交、财政、法律、通信。八大处之外尤有三场（试农、养鸡、制冰）、两局（植林、蚕农）、两所（航空、无线电），小两处（花卉、电气）、两院（病院、兽医）、一楼（继光楼，招待宾客之所）、一房（汽车）。此外又有咨议厅，设有顾问、咨议、随办营务、副官、差遣各等各级人员。
从民国九年到民国十三年为止，吴佩孚在洛阳编练的军队、直属，而且业已蔚然成军者，一共有五个正规师和两个非正规师。五个正规师系驻洛阳的第三师，由吴佩孚自任师长，第八师驻宜昌王汝勤，第十四师驻郑州靳云鹗，第二十师驻潼关阎治堂，第二十五师驻开封杨清臣。两个非正规师则为第四师胡景翼，第三十六师憨玉岷。
光是军饷和部队经费，每个月要花七十八万两银子。吴佩孚讲究队伍编制足兵足额，经济来源自给自足，他规定每一个正规师的月费是十四万两纹银，非正规师则发四万两银子的补助，不敷之数，责成当师长的就地取财，实报实销。
当年国家财政一片紊乱，各级队伍有国军之名，而无国军之实，除非强力逼迫中央，否则绝无可能领到兵饷。吴佩孚在洛阳开府治军五年多，他所支付的军费，高达纹银六百八十余万两之巨。或有人问这么巨大的款项从何而来？实则是赵倜对吴佩孚敬服得五体投地，心甘情愿地提供财源。赵倜将河南全省最大的一笔收入，京汉铁路南段的客货运费，一概拨给吴佩孚。所谓京汉铁路南段是从黄河南岸，一直到汉口大智门车站。因此，这一项收入自是相当可观。
吴佩孚练兵，有他的独特之秘，他研究古今中外历史，参详诸子百家兵法，发现历来武功之胜斯以蒙古为最。成吉思汗在位仅二十二年，但是他编练大军，亲率铁骑，平西辽、灭西夏、大破俄罗斯联军，纵横天下，所向披靡，奠定元朝奄有全亚、东欧、南洋群岛，威震中外，空前未有的大帝国基础。吴佩孚说：
“成吉思汗得以横行欧亚，百战百胜，正因为他有一支精锐部队，号称‘怯薛’，又曰‘怯薛歹’，人数仅只一万八千。他将这支‘怯薛’军带在身边，而由自己发号施令，亲身指挥。以‘怯薛’为核心队伍，然后扩展兵力，到他拥有欧亚两洲之境，远征欧西的极盛时期，说来令人难以相信，他的麾下士卒一共只有十三万八千名，那是元代兵额的最高峰了。”
“怯薛”和“怯薛歹”都是蒙古话，“怯薛”意指“轮流守卫”，“怯薛歹”是“护卫死士”的意思。吴佩孚将这一点研究得很透彻：蒙古兵的“怯薛”分三种：一曰“客卜帖兀勒”，亦即“宿卫”，负责夜战及夜间防护；一曰“土儿合兀惕”，汉语“侍卫”，职司日间作战暨警备；一曰“豁尔赤”又称“箭筒士”，那是帝后行帐行后的卫士。
一万八千名“怯薛”日夜跟随成吉思汗，他们都是骑兵，配备是一把雨伞、一锅一碗，肩背弓箭而腰跨大刀，他们每到一处，便就地征粮取食，因此不备粮秣，减轻负担。他们的任务除了作战，还有警卫、侦察、传令、兵站、交通、火攻，以及服侍主帅，治餐、兵站诸责。“怯薛”身强体壮，勇敢骠悍，而且风纪严明，行动敏捷。主帅指挥“怯薛”，由于日夕亲炙，长期相处而倍增了解，认识清楚，于是有如臂之使手，手之使指，非常灵活利便。
成吉思汗以“怯薛”为三军的中轴，攻坚摧锐，疾若狂飙，旌旗所指之处，斩将搴旗，攻城略地，可谓一支战志昂扬，雷霆万钧的攻击部队。往后元代的疆域拓广，用兵的机会增多，成吉思汗仍然运用“怯薛”的兵制，让每一位主帅，编练他们自己的“怯薛”，依然用之于攻击，至于地方戍守，则按事实需要，就地取材，在敌人境内召募编组。
吴佩孚很机密地运用“怯薛”兵制，训练他的队伍，他先自步兵第十二团开始，充实其设备、给养，改定其营制和章程，据说训练之严格，规模之庞大，不在日本士官学校之下。他将步兵第十二团扩充为一个师，一师三旅，一旅三团，一团三营，一营三连，一连三排，一排三班，一班十二人，再配备骑兵、炮兵、工兵、辎重兵、电信、铁道、航空各队，全师编制一总是一万二千名。再召募一批幼年兵，由一千之数逐渐扩充为六千人的一个旅，两支精锐加起来，恰好是成吉思汗“怯薛”的人数。
这支轴心部队的训练，是在极端保密的状态之下进行，中外人士都晓得吴佩孚练兵打仗极有把握，经常有人前往洛阳参观。吴佩孚的“怯薛”却始终秘不示人，惟独民国十三年有一次例外，日本派来的教育考察团，看到了“步兵第十二团”操练，但是他们仍然无法获悉内中的底蕴。
测绘出身的吴佩孚，居然能够每战必胜，用兵如神，名副其实地成为“常胜将军”，他兵学造诣之精深，与其不断求新、求进步的精神，以及其高瞻远瞩，目光如炬，这些都是很能令人折服的。早在民国十年左右，他即已深知陆海空三军严密配合，整体作战的重要，所以他的每一师里