勃的局面，便考虑在国民党左派和共产党人共同掌握武汉革命政权的情况下，他的各种反革命阴谋是难以实现的。因此，蒋介石便一反前言，提出迁都南昌，反对迁都武汉的主张。
这时，陈果夫刚从上海秘密来到南昌，与其弟陈立夫一起，不离蒋介石的左右，他们与张群、张静江等右派抱成一团，积极为蒋介石反共出谋划策。他们极力赞成蒋介石迁都南昌的主张，并为其大造舆论。
为了帮助蒋介石扩充势力，二陈以各种办法，将一些拥护蒋介石的人拉进国民党内。如1927年2月，陈果夫介绍陈布雷加入国民党，陈布雷即为蒋介石起草了《告黄埔同学书》，为蒋的派系斗争服务。随后，陈果夫又介绍潘公展加入国民党，并将潘与陈布雷派往上海，为迁都南昌、反对共产党制造舆论。当时，共产党员蒋先云也在陈立夫手下的秘书处工作，蒋先云是黄埔一期学生，是一个十分优秀的人才，由于是共产党员，陈立夫总是千方百计排挤他。蒋先云也不肯让步，每天晚上，二人同睡一室，总是就三民主义、共产主义谁优谁劣进行争论。后来，陈立夫竟直接向蒋介石汇报，诬蒋先云偷窃文件，引起蒋介石注意。不久，蒋介石免掉蒋先云机要秘书的职务。
1912年，孙中山就任中华民国大总统，上海各界欢送孙先生赴南京就职。二陈兄弟还分析了全国的革命形势及南昌在全国政治经济中的地位，并为蒋介石描绘了一幅发动反革命政变、一统天下的“美好”前景。他们认为，南昌虽然地理位置较为中心，但经济并不发达，政治上也难以号召国人，将来发动政变应在经济发达的上海，而南昌只能是目前反对迁都武汉的一个筹码，迁都南昌也只是权宜之计。二陈描绘的蓝图果然吸引了蒋介石，他要二陈将注意力放在上海，为将来在上海发动政变作准备。有了蒋介石的旨意，二陈便加紧在上海进行政变的准备。他们代蒋密电上海，要陈布雷、潘公展、虞洽卿一起秘密到南昌见蒋，会商北伐军占领上海后的有关党政军和涉外事宜的部署，计议策划反共清党。
有了这些秘密的准备，蒋介石在迁都问题上的态度更加强硬，在陈果夫、陈立夫的帮助下，蒋介石违背中央决议，以阴谋手段截留了途经南昌准备去武汉的第二批国民党中央委员和国民政府委员，其中包括代理国民政府主席谭延闿、代理国民党中常会主席张静江等，并于1927年1月3日在南昌召开所谓政治会议第六次临时会议，非法决定“中央党部与国民政府暂驻南昌”。蒋介石的目的就是要凭借军事力量，把国民党中央和国民政府掌握在自己手中，造成在南昌发号施令，压制武汉的局面，进而发动政变，夺取革命的最高权力。
蒋介石的无理决定，受到了武汉国民党左派和共产党人的坚决抵制，他们一致要求“中央党部及国民政府，照既定策略来鄂”。同时，为了缓和南昌与武汉的矛盾，武汉方面于1月26日决定派何香凝、顾孟余、邓演达三人去南昌，敦促在赣的中央委员来汉。何香凝等到南昌后，分别找各位中央委员做工作，要求他们为了北伐的最后胜利，能顾全大局，迅速去汉。在形势的压力下，滞留在南昌的委员们也表示拥护中央的决定，迁都武汉，并表示克日赴汉。
代理国民政府主席谭延闿首先表示愿意尽快赴汉，他还主动做陈果夫的工作，他知道陈果夫与蒋介石的特殊关系，如果陈果夫的思想通了，对蒋介石的态度会发生重大影响。谭延闿认为，在武汉，共产党人和鲍罗廷并不能起很大的作用，是“蒋先生看得太严重了”，武汉还是国民党的天下，他希望陈果夫与他一起去武汉。
此时，陈果夫为专门对付共产党，为蒋介石在上海发动反革命政变做准备，已于2月10日辞去国民党中央代理组织部长一职，改任国民党中央政治设计局筹备委员、政治会议上海分会委员。为完成反共大业，他时刻注视着武汉方面的情况，也很想到武汉去走走，观望一下武汉的形势，但他不敢自作主张，即向蒋介石请示，并提出了去武汉的理由。他认为要与武汉方面作对，一定要摸清对方的虚实，掌握对方的情况，而在南昌隔岸观火，是弄不清楚的，应该到武汉去看一看。蒋介石十分赞成陈果夫的看法，同意了他去武汉的请求，派他随谭延闿等一起赴汉。