用时机推翻总统，其罪不在张（勋）、倪（嗣冲）诸逆之下，请各省洞烛阴谋，一致反对。外交总长伍廷芳抵沪，宣布照常行使外交总长职权，电告驻京各国公使及中国驻外使馆，否认伪外部，声明所有外交事件，仍由其直接办理，然9日冯国璋便令免伍廷芳外交总长职。8日，留日中国学生1000余人在东京召开讨逆大会，戴季陶演说称前清“遗孽一日不除尽，中华民国国基一日不能巩固”。何香凝疾呼“国家兴亡，匹夫有责”，号召青年“尽国民一分子之责任”。神户华侨亦在中华会馆举行反对张勋复辟大会。9日，旅沪国会议员召开欢迎伍廷芳、程璧光大会，伍演说主张重办复辟，“斩草除根，以绝后患”，谭人凤称“调停为自杀政策，海军有护法精神，应以炮火扫除妖氛”。曹亚伯通电指斥冯国璋、段祺瑞之阴谋，称“张勋叛国，发源于冯国璋之总统梦。徐州每次会议，冯必派代表参加”；“张勋不过有阳恶之名，冯段有阴恶之实”，吁请“全国父兄子弟，——致共讨之，切勿为所欺”。10日，伍廷芳等致电冯国璋、段祺瑞，称“今清帝僭位，优待条件当然无效”，“无论何人，不能遽以保全优待条件，宣布天下”；主张严惩复辟祸首，“然首祸者决不止张勋一人”，“为贼谋主，勾结共事者，岂能以胁从自解”。11日吴景濂等致电冯玉祥，指出“此时扬言反对（张勋）之人，多属始与阴谋之辈”，请于“戮张逆之后，并正倪（嗣冲）罪”。
7月10日。章宗祥晤寺内正毅盼日支持段祺瑞。驻日公使章宗祥即电段祺瑞，谓日本首相寺内对“公重出山，使中国时局，早日解决，至为欣慰。深冀速组巩固之内阁，对于两国关系问题，渠必加以善意考虑”。12日，讨逆军东路司令段芝贵通过日驻华公使林权助，以盐税担保，向北京日本正金银行借款银元八万元，用于收买驻天坛张勋部队。直隶财政厅汪士元以所有滦州煤矿股票及公积存款折担保，向天津日本三菱银行借款100万日元，名义用于补助直隶金融，实为支持段祺瑞讨逆军费。20日，日，本通过对华政策，宣称“帝国政府认为，给予段政府以相当友好援助，以期中国时局的稳定，同时设法解决日中两国间的若干悬案，方为得策”。
中东铁路管理局局长霍尔瓦特下令关闭中东铁路沿线各酒厂，不准制造、贩卖酒品，致使740余家中国酒厂损失严重。
7月11日。山东曹县毛思忠所部“忠义军”千余人攻占县城，当由镇守使方玉善派兵镇剿，旋离城而去。后在丰县等处被官军击败，加之单、曹一带水灾，失去根据地。10月8日，毛思忠向四省剿匪司令张敬尧投降，即被遣散。
7月12日。张勋所部连续发动兵变。9日，冯国璋令倪嗣冲节制张勋在徐军队，但倪无法控制局面。是日，徐州张勋辫兵两营不受节制哗变，被劫者百数十家，遭火者20余家，死10余人，财产损失数十万元。13日，驻徐海一带张勋辫兵统领张文生部不受倪嗣冲招抚，约同哗变。18日，江苏沭阳县驻军第十六营哗变，捣毁邮电局，抢劫商民200余家，与商民巷战八小时，后不支乘夜纵火逃遁。不得已冯国璋令张勋所部徐州镇守使张文生、海州镇守使白宝山照旧供职。9月2日，驻徐州城外定武军第五十四营士兵两哨，夜间忽又哗变，肆意抢劫，旋被张文生派兵击散。同日，安庆安武军第八路第三、五两营夜间突发兵变，统领李良臣被杀，并肆意抢掠，天明时方散。7日夜，驻安徽当涂县城内定武军第四、六两营哗变，肆行抢掠，经竭力镇压，旋被平定。
7月13日。台湾遭受台风袭击。台风最大风速每秒33米，低气压969，8毫巴，受灾严重的台东一带死19人，伤18人，房屋全倒者1325家，半倒者1030家。
7月14日。黎元洪通电去职。段祺瑞由津入京，复任国务总理，黎元洪通电去职，宣告以后息影家园，不问政治。冯国璋任命张志潭为国务院秘书长，原任张国淦免职。15日，冯国璋令准免陆军总长王士珍本职，以段祺瑞兼任；特任汪大燮为外交总长，刘冠雄为海军总长，萨镇冰为海疆巡阅使。17日，冯国璋任命段祺瑞内阁各部总长：内务汤化龙，财政梁启超，司法林长民，农商张国淦，交通曹汝霖。同时免去范源濂、李经羲、江庸、李盛铎、龙建章等人内务、财政、司法、农商、交通各总长职，并令嘉奖段祺瑞及讨逆军前敌将士。