阁全书每册的首页都钤有“文源阁宝”和“古稀天子”印，末页则钤上“圆明园宝”和“信天主人”印，朱色晶莹，又为全书增色不少，
阁书被毁
文源阁落成后，乾隆皇帝每年驻跸圆明园，几乎都要來此修憩观书，吟咏題诗，《四库全书》抄毕送藏文源阁后，伴随着“康雍乾盛世”的余光，确也度过了半个多世纪宁静祥和的时光，但是好景不长，咸丰十年（1860），英法联军攻占北京，他们在饱掠圆明园珍宝之后，举全园而火焚之，大火在这座举世闻名的“万园之园”中肆虐了三日，文源阁和其中的《四库全书》以及贮藏于味腴书屋中的一套《四库全书荟要》也在这场浩劫中化为灰烬，阁与书从告竣送藏到被毁，存世仅七十余年，
现在的文源阁阁已不存，仅余阁基，其上青砖仍较为规整；曲池已涸，高大的“石玲峰”因民国时两股土匪争相盗卖不得，被其中一方炸为两截，轰然坍于蔓草之中，当年曾在四库馆担任副总裁的彭元瑞、曹文埴題写的诗文碑刻，虽湮沒在一片荒芜中，尚依稀可辨；而乾隆帝的御碑已挪至文津街的国家图书馆分馆院内，文字仅存其半，整个文源阁遗址和旁边的舍卫城遗址遥相呼应，偶有游人凭吊至此，不胜唏嘘慨叹，至于阁中所藏《四库全书》，仅闻民国时湖州刘承干嘉业堂曾藏有钤“文源阁宝”的全书六册，此后人世间便不再有此惊鸿一现了，
范氏天一阁
范氏天一阁创建于明代嘉靖末年，始建者是当时的兵部右侍郎范钦，范钦一生爱书成癖，酷爱藏书，他搜集书籍的原则是“不薄古人厚今人”，嘉靖三十九年，范钦卸职归里，为使所搜集的藏书能永久保存，在宁波建楼6间，做为藏书之所，即为“天一阁”，范钦死后，其长子范大冲继承了藏书，为使所藏之书不至分散丢失，为其后代定了一条家规，就是“代不分书，书不出阁”，因此，直到清朝初年，范钦的曾孙范光文，仍将天一阁的书籍完好地保存着，
至乾隆时代，皇帝为了“嘉惠艺林，启牖后学，公天下之好”，“用昭文治之盛”，决定编纂《四库全书》，所谓《四库全书》，就是将全部书分为经、史、子、集四类，分别编纂而成，为了广泛“搜罗古今载籍”，乾隆皇帝下令，要各省多方面加意搜集古籍和遗书，送交上來以备编纂之用，仅宁波天一阁范钦的后代范懋柱就送交了638种珍贵的古书，其中被收录到《四库全书》中的有96种，列入存目的为377种，
《四库全书》
乾隆三十八年，《四库全书》的编纂正式开始，并设《四库全书》馆，负责全部工作，乾隆皇帝选派了《阅微草堂笔记》的作者纪昀（字晓岚）和陆锡熊为总纂，陆费墀担任总校，担任编纂的著名学者有邵晋涵、戴震、周永平、姚鼐、朱筠等，前后共有360余人，加上缮写、装订等工作，最多时有3000余人，直到乾隆五十二年，共用15年的时间，编成此书，全书共编入各类书籍3500余种，共计7.9万余卷，装订3.6万册，总计有230万页，9.97亿字，而且均以毛笔正楷抄写，这部巨著搜集了自我国周代以來至乾隆年间编书时为止3000余年的政治、经济、哲学、文学、天算、舆地、科技、医卜等方面的重要著作，成为中外历史上最大的一部百科丛书，
《四库全书》共缮写了7部，每一部都是用香楠木二片上下夹之，并束以绸带，装在香楠木匣内，书面都是绢面，“经部”用黄绢，“经解”用绿绢，“史部”用红绢，“子部”用蓝绢，“集部”用灰绢，每匣上面均刻有书名，7部《四库全书》，前4部分藏于北京紫禁城皇宫之“文渊阁”，圆明园之“文源阁”，热河行宫之“文津阁”，奉天行宫（今沈阳）之“文溯阁”，这就是著名的“内廷四阁”，或称“北四阁”，该四阁的建筑格局，也都是按宁波“天一阁”营造的，《四库全书》编成之后，乾隆兴奋地赋诗道：“昨岁书成楠架陈，題为四色一时新；雨霉风凉敕苑吏，继晷如期嘉翰臣”，乾隆皇帝认为江浙一带是文物之邦，人才辈出之地，认为《四库全书》应当广布流传，以光文治，于是将《四库全书》的后3部，分藏于扬州大观堂之“文汇阁”，镇江之金山寺之“文宗阁”，杭州孤山圣因寺之“文澜阁”，这就是所谓的“江浙三阁”，或称“南三阁”，
《四库全书》是中华民族文化的瑰宝，也是举世闻名的巨著，“文源阁”在当时，既是全国的七大皇家图书馆之一，也是圆明三园中的第一座皇家图书馆，
文渊阁中的文源阁碑被移至燕京大学和北京图书馆旧馆，