这些证据主要有赵秉钧与应夔丞函电、应和洪述祖的函电和赵与洪的函电。赵在本年1月14日交给应夔丞应密电码一本，要应有电报直接寄国务院。应于1月26日寄赵电报中有“国会盲争，真象已得，洪回面详”等语。2月1日，应寄赵电报中有“宪法起草以文字鼓吹、金钱联合，主张两纲：一除总理外不投票，一解散国会。此外，何海鸣、戴天仇等已另筹对待”等语。2月2日应犯寄程经世转赵电报中有“孙、黄、黎、宋运动极烈，民党忽主宋任总理。已由日本购得孙、黄、宋劣史，警厅供钞宋犯骗案、刑事提票，用照辑印十万册，拟从横滨发行”等语。
洪述祖与应往来函电很多，重要的有以下几件：2月1日洪述祖致应函，有“大题目总以做一篇激烈文章，方有价值”等语。2月2日洪致应函，有“要紧文章，已略露一句，说必有激烈举动。吾弟须于题前径密电老赵，索一数目”等语。2月4日洪致应函，有“冬电到赵处，即交兄手，面呈总统，阅后色颇喜。说弟颇有本事，既有把握，即望进行云云。兄又略提款事，渠说将宋骗案情及照出之提票式寄来，以为征信。望弟以后用川密与兄”等语。2月8日洪致应函，有“宋辈有无觅处，中央对此似颇注意”等语。2月11日洪致应函，有“宋件到手，即来索款”等语。2月22日洪致应犯函，有“来函已面呈总统总理阅过，以后勿通电国务院。因智老已将应密电本交来，恐程君不机密，纯令归兄一手经理。请款总要在物件到后，为数不可过30万”等语。应犯致洪述祖川密蒸电，有“八厘公债，在上海指定义足，六六二折买350万。请转呈，当日复”等语。3月13日洪述祖致应，“川密。蒸电已交财政长核办。债票只六厘，恐折扣大，通不过。毁宋酬勋位，相度机宜，妥筹办理”等语。3月14日，应犯致洪述祖应密寒电，有“梁山匪魁，顷又四处扰乱，危险实甚。已发紧急命令，设法剿捕。乞转呈，候示”等语。3月17日洪述祖致应犯应密铣电，有“寒电到。债票特别，准何日缴现领票，另电润我若干，今日复”等语。3月18日又致应犯“川密。寒电就应即照办”等语。3月19日，洪又致应犯电，有“事速进行”一语。3月20日半夜两点钟，即宋教仁被害之日，应犯致洪述祖川密号电，有“二十日十分钟所发急令已达到，请先呈报”等语。3月21日又致洪川密个电，有“号电谅悉。匪魁已灭，我军一无伤亡，堪慰。望转呈”等语。3月23日洪述祖致应犯函，有“号个两电均悉，不再另复。鄙人于四月七号到沪”等语。此函系快信，于应犯被捕后始由邮局递到，津局曾电沪局追回。当时，沪局已将此函送交涉使署，转送到程德全处。洪致应各函洪称应为弟，自称为兄。
除洪、应，赵、应之间的函电外，从应家中搜获证据中，有赵秉钧致洪述祖数函，应是洪述祖将原函寄交应的。内赵致洪函，有“应君领子不甚接头，仍请兄一手经理，与总统说定才行”等语。应自造“监督议院政府神圣裁判机关简明宣告文”，誊写本共42遍，准备分寄各处报馆，已贴邮票，尚未发出，这就是国务院于3月27日据以通电各省之件。
以上证据，十分明显地揭示了袁、赵、洪、应相互勾结，谋杀宋教仁的事实。
4月26日善后大借款合同签订美国退出银行团，五国急于签署对华贷款协议。而在中国国内，由于国会成立和总统选举，激化了袁世凯与革命党人的矛盾。宋教仁案使革命党人讨袁呼声高涨。袁世凯为了加强其对付革命党人的力量，也急于想弄到钱。因此，袁世凯一方面再次迁就列强，接受了五顾问的方案，即英国占盐务稽核总所会办一席，后任丁恩，法、俄各占审计院顾问一席，后分别任宝道、葛诺发，德占审计院稽核外债室洋稽核员及盐务副总稽核各一席，后分别任龙伯、斯泰老。另一方面，袁世凯在与俄国进行的秘密谈判中，屈从俄国的压力，承认俄国在蒙古的扩张。而列强看到革命党人高涨的反袁情绪，也急于达成善后合同，以便支持袁世凯。于是，中外反动势力达成交易的时机终于到来。4月22日，袁世凯命令国务总理赵秉钧、外交总长陆征祥、财政总长周学熙会同签字。24日，签订了草合同。25日，袁政府秘密向有关国家去函并递交了顾问合同，满足了列强监督中国财政的要求。26日夜至27日凌晨，在北京汇丰银行大楼，五国银行团与袁世凯政府经过最后谈判，签署了2500万英镑的《中国政府善后借款合同》。列强通过善后借款，进一步加强了对中国的统治，使中国进一步殖民地化。继海关之后，列强又控制了中国的主要财政收入之一的盐税，中国政府提用盐税抵还外债后的余额都必须经过银行团的核准。列强通过对盐税的管理，通过对善后借款用途的稽核，通过对审计院的干预，也就监督着中国的财政；通过监督和控制中国财政，列强就可以摆布中国的政局，使北洋统治者成为其得心应手的工具。善后借款条件严酷，是一次高利的剥削。这次借款期限长达47年，为从来所未有，年息五厘，累计须付息达42893597英镑。善后借款折扣大，中国政府实收八四，仅得210