3月24日袁世凯任命胡万泰为安徽陆军第一师师长，黎天才为江南留鄂陆军第一师师长。
3月25日孙中山返抵上海当晚与黄兴等党内领导人商讨对策。计划由参议院预期集会，提出弹劾袁世凯案。
上海会审公堂对宋案初步审讯，主使犯应夔丞狡赖，凶犯武士英供认不讳。
江苏都督程德全应黄兴电邀由南京抵上海，督率各员亲自办理宋案。”日，江苏民政长应德闳也到上海会同程德全办理宋案。
3月26日袁世凯任命张謇督办导淮事宜。
3月27日在缴获的应夔丞刺宋通信中，有一封信后附有一《监督议院政府神圣裁判机关简明宣言书》，该书除宋教仁外，还把梁启超、孙中山等都列为暗杀对象，为此，国务院通电各省都督、民政长密查防范。
中国政府同意与英国谈判西藏问题中国政府于1912年12月23日，对英国8月17日照会逐条作了答复，拒绝了英国企图订立新约的要求，这使英国十分不满意，因为拒订新约，意味着认为旧约有效，从而也就确认英国无权干涉西藏内政。英国政府在对中国答复的答复中，无理认为中国答复无法讨论，英国只能以1912年8月27日所备节略为根据，进行谈判。朱尔典公然威胁外交总长陆征祥：“不订约恐怕办不到”。此时，正值“善后大借款”前夕，为了不得罪英国人，北京政府终于1913年3月27日通知朱尔典，称中国准备按照8月17日照会中所列条件与英国会商。经过一年多的抵制、拖延、犹豫，北京政府最终还是只有屈服于英国的压力。双方经过近半年的谈判，终于在10月召开西姆拉会议讨论西藏问题。
3月28日袁世凯批复临时稽勋局局长呈，已故前农林总长宋教仁照改订暂行赏恤章程甲等例，优给恤金并令饬国史馆立传文并批文陈述一生事迹。并令该局查明宋教仁有子几人，将其派遣游学，俾资造就。
****自1912年底胁迫驻藏办事长官钟颖撤离拉萨市，移驻靖西后，复以兵力逼钟离藏。是日钟被迫再移往中印边境之那当，旋至印度噶伦堡，复遭当地政府驱逐，5月15日到达印度首都新德里。6月1日，钟接国务院转达袁世凯令，着其“回国听候查办”。6月1日，袁世凯正式任命陆兴棋为护理驻藏办事长官。钟颖遂于6月6日将印信交陆兴祺，旋即离印回国。
3月29日汉冶萍公司股东大会，举盛宣怀为总理。
袁世凯索要宋案证据刺宋要犯应夔丞、武士英落网后，袁世凯惶恐万状。本日，他密电程德全说：“连接南方私人来电，宋案牵涉洪述祖，是否确实？究何情节？宜速查复，以凭核办。”接着又电催程报告“证据”，以谋对付办法。他的机要秘书张一麟这时也多次密电程德全，要他把“牵涉中央证据向英厅索取”，派人送京，并特别叮咛说：“可不作正式报告。”但是，袁政府当时还不能完全控制江苏和上海一带，在孙中山和黄兴的强烈要求下，4月25日程德全、应德闳公布了宋案证据，使人们看到了袁世凯的真面目。
3月30日国民党本部在北京开追悼宋教仁大会到会者千余人，吴景濂、张继、林述庆、张耀曾、谷钟秀、李肇甫、孙毓筠等均与会。吴景濂宣布开会主旨，指出宋教仁之死，非独国民党死一理事，实********死一伟人；宋为政见而死，“吾辈当继先生未尽之志，庶先生虽死犹生”。李肇甫陈说宋之历史。赵秉钧派代表警察总监王治馨出席大会。王治馨在会上说：“赵、宋因政党内阁问题，颇有密切关系。自宋被刺后，获犯应桂馨，搜出证据，牵涉内务部秘书洪述祖。应、洪又有密切关系。因此袁总统不免疑赵，而赵以洪时往袁府，亦疑袁授意。及前日赵与袁面谈，彼此始坦然无疑。惟袁谓：宋被刺前，洪曾有一次说及总统行政诸多掣肘，皆由反对党政见不同，何不收拾一二人，以警其余。袁答谓，反对者既为政党，则非一二人，故如此办法，实属不合云。现宋果被刺死，难保非洪借此为迎合意旨之媒。惟有极力拿治，以对死者。鄙人为警长，已搜出证据多端，另抄一本，皆洪、应秘密通信，可交吴莲伯，以供党员参考。并通电拿洪，以期水落石出。云云。”王作为袁、赵手下的特务头目，向各界进一步证明了袁、赵确曾与闻杀宋重案。为此袁世凯十分恼怒，但一时大敌当前，未动声色。至1914年9月，赵秉钧被毒毙后，袁以王治馨坐赃500元为罪名，下令逮捕，并于同年10月23日枪毙。