生问题，如《速开国会案》、《商办铁路非经国会协赞不得收为国有案》、《运输规则案》、《铁路公司适用商律案》、《振兴外藩实业并划一刑律案》、《昭雪戊戌冤狱案》、《速立官制提前实行案》、《速立责任内阁案》、《剪发易服案》、《报律案》、《禁烟案》、《著作权案》等等。但由于不是议而不决，就是决而不行，因此多无结果。其中《速开国会案》是本次常年会中最引人关注和讨论最为热烈的一个议案，但最终无任何结果。
资政院上奏议决修筑蒙古铁路。蒙古铁路共计3条，即张恰铁路（张家口至恰克图）、张锦铁路（张家口至锦州）、库伊铁路（库伦到伊犁）。资政院的决议认为：张恰铁路是蒙东贯通内外蒙古由南到北的第一条铁路要道，应责成邮传部迅速兴办；张锦铁路也是内蒙古的交通要道，并已经邮传部规划，也应兴办；只是铁路直达热河不妥，“当不如避越热河，由多伦厅、赤峰州、朝阳府以达锦州为善”库伊铁路东西横贯外蒙古，也很重要，只是未经实地测量，经费多少很难估算，应该缓办。
清廷命广州将军增祺入京陛见，以广州副都统孚琦署理广州将军。
1月12日。俄国公使廓索维慈照会外务部，要求续订1881年《陆路通向章程》，提出35款，损及蒙占、新疆、东北权益。
1月13日。清政府处理东北鼠疫问题。东三省鼠疫流行，清政府决定在山海关一带设局严防蔓延，并拨款在奉天（今辽宁）增设医院检疫所。下令奉天至山海关的火车，除头等客车外，其余一律暂时停开，从各省港口到上海的船只，也必须照章停航，听候检查鼠疫。21日，因试署吉林西北路道于驷兴防疫不力，锡良奏准将其革职，留在哈尔滨帮助办理防疫事宜，同时派郭宗熙总办哈尔滨防疫事宜，并暂时兼署吉林西北路道。31日，锡良又奏准暂行撤消李澍恩试署吉林西南路道官职，令其留在长春帮办防疫事宜，以孟宪彝暂行署理吉林西南路道。本月，吉林省成立防疫总局，负责全省防疫事宜。2月11日，日本关东都督大岛义昌会晤东三省总督锡良，磋商中日联合防疫事宜。2月19日，清政府派外务部右丞施肇基前赴奉天，参加各国防疫会议。直至4月28日，奉天省鼠疫才被消灭，中日防疫会议宣布撤消。
清政府重申禁烟令。是日的上谕警告说：“其已经禁种之处，断不准毒卉复萌，其已经戒断之人，断不准旧污复染”命令各督抚懔遵历次谕旨，督饬部下官员迅速查禁，不得拖延。如果地方官仍然粉饰虚报，在民政部和度支部检验核实后，将从严惩处。此前，清廷曾令度支部赴各省检查禁烟情况，发现有奏报不实的现象。
清政府加派锡良等人参加编订外省官制。是日上谕以厘定外省官制必须详慎。加派东三省总督锡良、直隶总督陈夔龙、两江总督张人骏、湖广总督瑞四人会同宪政编查馆王大臣研究编定外省官制，遇有重要问题条目，要随时电奏请示朝廷。15日，应锡良和瑞的请求，又加派云贵总督李经羲参加编定外省官制。
1月17日。清政府颁布《修正逐年筹备事宜清单》。清单列出了1910年（宣统二年）至1913年（宣统五年）设立议院以前清政府为实行宪政而计划筹办的事宜。具体项目是，1910年：厘定内阁官制、弼德院官制，颁布新刑律，续办地方自治，续办各级审判厅，续办八旗生计。1911年（宣统三年）：颁布内阁官制设立内阁，颁布弼德院官制设立弼德院，颁布施行内外官制，颁布会计法，厘定国家税地方税各项章程，厘定皇室经费，颁布行政审判院法设立行政审判院，颁布审计院法，颁布民律、商律、刑律、民事诉讼律，颁布户籍法，试报各省户口总数，续办地方自治，续办各级审判厅，续筹八旗生计。1912年（宣统四年）：颁布宪法、《皇室大典》、议院法和上下议院议员选举法，举行上下议院议员选举，确定预算决算，设立审计院，实行新刑律、商律、民律、刑事民事诉讼律，续办地方自治，直省、府、厅、州、县城治各级审判厅一律成立，续筹八旗生计。1913年颁布《召集议员之诏》，实行开设议院。这一清单是清政府命令宪政编查馆编订修正的，经清廷审核同意后，于是日颁布。
增棋奏请将香洲定为无税口岸。广州将军兼署两广总督增祺上奏清政府，请将自开商埠的香洲定为无税口岸。增祺在奏折中指出“西人商战之局恒以广开无税口岸为无上妙策，远而南洋各埠，近而香港一隅数十年来最为发达”，其原因即在于是无税口岸。香洲与澳、港相邻，并且同是贸易之地，但“人则一切自由，我则动多缚束”，这是为渊驱鱼，自取劣势的政策。增棋请求参照拱北海关的做法，在往来香洲必经之前山吉大、对海北山等地设立分厂，严防走私，而在香洲则免于纳税。他认为这是“有益于商而无损于国”的好办法，奏请清廷先命税务处立案，将香洲定为无税口岸，再制订免税专章，筹划防止弊漏的办法。不久，税务处上折，同意增祺的计划，请准朝廷将其暂定为无税口岸，同时指出“如有商民自开商埠者概不得援以为例”。清政府旋即予以批准。