鲔先于刘演起事，与刘演没有过节，虽力主杀刘演，是为了拥戴更始而杀刘演，在更始诸将中，朱鲔的忠贞也是独一无二的。朱鲔辞胶东王而坚守洛阳，与寇恂、冯异死战数月坚守不出。更始投降赤眉，洛阳孤立无援，朱鲔仍死守洛阳。所以朱鲔以杀刘演为惭而不肯降是可以原谅的。所以刘秀不计私怨，发大义而使然。事实证明刘秀的洞察是正确的，朱鲔成为刘秀的部将再无反心。
刘秀占据洛阳以后，于公元25年11月27日车驾人城，幸南官，遂定都洛阳。此时，据刘秀起兵整整三年。自持节北渡整整二年。三度寒暑，历尽风险，刘秀终于以胜利者的姿态回到了洛阳，并由此开创一百九十多年的东汉政权。
刘秀称帝建都以后，一方面指挥军队继续作战，开始向国家统一的目标迈进，另一方面则设置官职，致力于国家政权和制度的建设，以巩固初建的东汉政权。
刘秀设太傅一职，以卓茂为太傅，官职仅次于皇帝，管理国家大事。
其次，是设置三公。先后拜邓禹为大司徒，王梁为大司空，吴汉为大司马。刘秀以邓禹为大司徒是根据其才能和功绩确定的，而命王梁为大司空则是依据图谶来决定的。王梁虽然有功，但功不及大司徒，他官职很短，后被宋弘接任。吴汉行大司马之职也经波折，吴汉深得刘秀信任，在诸将中颇有威望，行大司马当之无愧。
再次是设九卿之职。同时，司隶校尉、御史中丞和尚书令也设置完善。刘秀还完善将军制度。大司马为朝廷之下最高武官，骠骑将军次之；其次是有名号的大将军；再次是前、后、左、右将军；前后左右将军都是打仗时临时任命，仗打完了就不再是将军了。然后是各种名号的将军，低于名号将军的是偏将军等。这些制度的完善有利于对诸将的指挥调度，为统一战争奠定了坚实的基础。
刘秀即位后在加强制度建设的同时，又正式分封诸侯王和列侯，跟随他打天下的将领以贡献大小进行封侯，有的封给四县的领地，有的封万户侯，被封的将领有二十八个之多，刘秀兑现了他的诺言，有功之臣得以有个圆满归宿，后来人们把刘秀封的功臣称为二十八宿。