1928年冬，西藏派驻五台山堪布罗桑巴桑奉十三世达赖喇嘛之命，赴南京谒见蒋介石，目的在于面陈藏事，探试国民政府对西藏特别是对达赖喇嘛的态度。蒋介石接见了罗桑巴桑，并致函十三世达赖喇嘛，函称“西藏为我中华民族之一，政府正督饬蒙藏委员会调查实际，用资建设”。指出十三世达赖喇嘛“深明大义，内向情殷，此后愈当并力一心，修内政而御外侮”。1928年2月，经南京国民政府批准，班禅驻南京办事处成立。1929年8月，西藏驻北京雍和宫堪布贡觉仲尼等人赴山西拜见蒙藏委员会委员长阎锡山，面陈十三世达赖喇嘛的三点声明：达赖并无联英之事，也并未与英国发生关系；因西藏与英（英印政府）相壤毗连，不能不与之略事敷衍；达赖仇华属误传，达赖、班禅感情素惬，因班禅属下之人行为不法，达赖逮捕数人，班禅惧而出走。同年9月，贡觉仲尼到南京，谒见蒋介石时，重复达赖不亲英，不背中央，欢迎九世班禅返藏的声明内容。此后，蒙藏委员会派员与贡觉仲尼商谈西藏事务，贡觉仲尼代表西藏方面一再表示“愿意输诚中央”，“诚意欢迎班禅大师回藏”。“将来西藏的行政、军事、外交等事务归中央管理”，同意“中央派出驻藏长官”等。
1929年12月，国民政府任命贡觉仲尼为“赴藏慰问委员”，执蒋介石给十三世达赖喇嘛和噶伦擦绒的信及蒙藏委员会解决西藏问题的8条意见入藏。到达拉萨时，受到了达赖喇嘛和西藏地方僧俗官员的高规格迎接。十三世达赖喇嘛对收到蒋介石的信函及礼品十分欣喜。对蒙藏委员会的8条意见，由噶厦作了具体答复，态度内容与以前的声明基本一致。惟九世班禅返藏一事，因英人唆使，隔阂尚存，提出了异议。1931年3月21日，经南京国民政府批准，西藏办事处正式成立，贡觉仲尼任办事处处长。
1929年，南京国民政府派文官处书记刘曼卿进藏，次年3月到达拉萨。刘曼卿通晓藏语，在拉萨各界广泛宣传国民政府的西藏政策，两次拜见十三世达赖喇嘛。达赖喇嘛说，“吾不敢背中央前已言之”，“吾所最希求者即中国之真正和平统一”，“英国人对吾确有诱惑之念，但吾知主权不可失”等，并捎书信致蒋介石。国民政府抓住贡觉仲尼、刘曼卿进藏效果显著，达赖喇嘛态度向内的时机，于1930年底又派蒙藏委员会官员谢国梁进藏，其主要任务是将国民政府解决西藏问题的11条意见（其基本内容与贡觉仲尼进藏所执的8条意见一致）传达给十三世达赖喇嘛和噶厦政府。但谢国梁不幸途中病故。
1931年5月，南京国民政府召开国民会议，贡觉仲尼、曲批图丹、巫明远、楚臣丹增、阿旺坚赞、降巴曲旺6人作为西藏地方代表出席会议；楚臣尼玛、罗桑桑杰、降巴年札3人为西藏地方列席代表参加会议。九世班禅应邀出席会议，并在会议上发表祝词。班禅方面出席会议的代表是罗桑楚臣、罗桑坚赞、罗桑昂嘉、王乐阶4人；列席代表是邵章、金孝志、白瑞麟、海涛、樊泽培5人。会议通过的《中华民国训政时期约法》，以国家法律形式确定了西藏是中国领土的一部分。此次会议以后的所有全国性会议，均有西藏代表参加。至此，西藏地方与中央政府的关系实现了全面恢复。
三、热振事件
1933年12月17日，十三世达赖喇嘛圆寂后，经当时的所谓“西藏国民大会”讨论，并报请南京国民政府批准，册封热振第五世活佛土登坚白益西·丹巴坚赞为摄政王，代行达赖喇嘛职权，并于1934年5月29日赐封为“辅国普化禅师”。
热振寺系噶当派的首寺，创立于11世纪中期。15世纪初，宗喀巴大师根据噶当派的教义，并融合其他教派教理创立了格鲁派。因此，格鲁派可说是噶当派的进一步发展。热振寺后来也改宗格鲁派。该寺热振活佛，为青海名僧、七世达赖的经师阿旺却丹的历辈转世，是一个有名的转世活佛系统。因该寺创建较早、影响较大，包括五世热振活佛，曾有两世热振活佛任摄政王，同时也发生了两次“热振事件”。
清道光二十六年（1846年），道光皇帝敕封热振呼图克图为西藏摄政王。清同治元年（1862年），当时已卸任的噶伦夏扎哇·旺曲结布欲夺摄政之职，贿赂收买了时为哲蚌寺堪布的杰巴等人，乘给热振活佛呈文，就哲蚌寺扎巴薪俸一事请示热振活佛发钱还是发物，热振活佛批示发物。杰巴便以热振活佛“克扣薪俸”大造舆论，煽动不明真相的僧众聚集在摄政府前闹事寻衅。驻藏大臣满庆等人也因收受了夏扎等人的贿赂，名为调节，实则偏袒杰巴等人，致使事态不断扩大。闹事僧众打开布达拉宫弹药库，取出武器，炮轰摄政府。热振活佛一面组织反击，一面向驻藏大臣报告，终因寡不敌众而逃出拉萨，取道青海赴北京向清廷陈述原委。次年在北京圆寂。因当时清廷外患频生，国内太平天国农民革命与之分庭对峙，无暇顾及西藏内部纷争。热振事件便不了了之。这次事件，史称第一次“热振事件”。热振活佛在任期间，维护清朝中央统治，重视藏内各方团结，因治藏有功，曾多次受到清廷褒奖。