清宣统三年）春，赵尔丰升任署理四川总督，傅嵩灯林代理川滇边务大臣，继续推行赵尔丰既定的改土归流新政。从1905年到1911年7年时间内，在赵尔丰、傅嵩灯林的积极经营下，川边藏区全部实现了改土归流。
1911年是中国历史发生划时代巨大变化的一年。当傅嵩灯林完成改土归流、向清廷奏请建立西康行省之时，四川爆发了“保路运动”。宣统三年武昌起义成功，推翻了清王朝的统治，延续了两千多年的中国封建帝制宣告结束。因而建立西康行省的计划未能实现。辛亥革命后，因战乱四起，军阀割据，边务大臣久无人担任，川边藏区的土司头人们又乘机恢复了旧制。
赵尔丰经营川边藏区，其反对帝国主义入侵、维护国家统一的主旨无疑是正确的，改土归流也不失为一种进步，客观上加强了藏区与内地的联系和交流，他的作为，总体上反映了时代历史的要求。但赵尔丰推行新政急于求成，采取了野蛮的杀戮镇压政策，在川边藏区人民中留下了深刻的历史阴影。他所推行的一些有关寺庙、民俗方面的改革措施，不顾藏传佛教文化、民族文化和藏区的历史现实，按照汉族的伦理道德规范强行“革新”，以民族压迫的方式来完成，这是封建王朝反动性的暴露，是清末川边藏区新政的消极方面。
【第四节】孙中山提出五族共和，民国政府维护国家统一
1911年的辛亥革命推翻了清王朝的专制统治，结束了中国两千多年的封建帝制。民国初期，虽然军阀混战、民不聊生，但无论是孙中山先生还是此后的当政者，均依据历史定例，维护民国政府对西藏行使国家主权，坚持西藏是中国领土不可分割的一部分的原则。
一、孙中山提出五族共和，民国政府坚持对西藏行使主权
1912年1月1日，孙中山在南京就任中华民国临时大总统，发表了著名的《中华民国临时大总统宣言》，提出：“国家之本，在于人民，合汉、满、蒙、回、藏诸地为一国，则合汉、满、蒙、回、藏诸族为一人，是曰民族之统一。”“枢机成于中央，斯经纬周于四至，是曰领土之统一。”
宣布中华民国是合汉、满、蒙、回、藏各族人民为一体的共和国，坚持“五族共和”是中华民国中央政府的基本立国方略。确定中华民国国旗为五色旗，象征汉、满、蒙、回、藏5个主要民族为一体。孙中山在这里提出的五族，当然也包括这五个民族以外的其他各少数民族。1912年3月11日，中华民国政府颁布《中华民国临时约法》，总纲中规定：“中华民国领土，为二十二行省、内外蒙古、西藏、青海。”第三章第十八条规定，西藏和各行省一样，选派5人出席参议院，共商国是，把西藏的主权地位明确载入中华民国的根本大法。
1912年4月，孙中山辞去临时大总统，由袁世凯继任，建立了民国北京政府。
民国北京政府建立伊始，就对藏、蒙、回疆的地位问题发布命令，指出：“现在五族共和，凡蒙、藏、回疆各地方，同为我中华民国领土，则蒙、藏、回疆各民族，即同为我中华民国国民。此后蒙、藏、回疆等处，自应统筹规划，以谋内政之统一，而冀民族之大同。”
1912年7月，民国政府设立蒙藏事务局，取代清朝理藩院职责，专门负责蒙藏事务，1914年5月，改蒙藏事务局为蒙藏院，直接隶属总统管辖。
民国初，辛亥革命风暴波及全国，四川的保路运动浪潮起伏，民国政府无暇顾及西藏。此时的原清廷驻藏军队军纪松弛，又缺粮饷，军队首领时而拥护共和，号称革命，时而叫嚷勤王，称赞帝制。英帝国主义乘机插手，妄图分裂中国，搞西藏独立。1911年11月，郭元珍等军人发动兵变，囚禁联豫，藏内人心惶惶。英印政府以调停为幌子，派员进藏，叫嚣西藏“不受中国的干预”。1912年6月，民国政府派川督尹昌衡率军入藏，滇督蔡锷也派兵支援，皆因英国干预等原因受阻。1912年8月，英使朱尔典照会民国政府，提出英国虽承认中国在西藏的宗主权，但否认中国有干预西藏内部事务的权力；中国政府不能将西藏视为中国的行省，不得无限制派兵驻西藏各地等。公然策动西藏独立。同时，沙俄也提出在“西藏问题上享有与英国同样的权力”。
为维护国家主权，1912年5月，袁世凯任命清末驻藏陆军统领钟颖为西藏办事长官，不久钟颖被迫离藏。民国政府又任命陆兴祺为护理西藏办事长官。与此同时，袁世凯派遣杨芬等人与达赖喇嘛联系，未果。于1912年9月又派马吉符等人入藏，因英国殖民主义者作梗未能进藏。1913年6月，北京政府任命陈贻范为西藏宣抚使，胡汉民为副使，后又命王鉴清为执行正宣抚事西藏副抚使，皆因英国殖民主义者把持了西藏大权而未能入藏履行使命。