（2）具有大北方种类的动物。海拔在2000米以上，气候为北亚热带、温带和暖温带的山地，生长着不少北方种类的动物，像兽类中的白唇、岩羊、西藏鼠兔、喜马拉雅旱獭和鸟类中的三趾啄木鸟、星头啄木鸟等。云南的三趾啄木鸟与北方的有所不同，如上下体要黑得多，头顶几乎全为黑色，只有少数白色细点，顶部和翅膀上的白斑要比北方的小。
（3）具有大南方种类的动物。海拔1600米以下，气候为热带和亚热带的山地和河谷地区，分布着大南方种类的动物，像兽类中的滇金丝猴、猕猴、短尾猴、斑灵猫、长吻松鼠等。滇金丝猴的毛色显金黄色，毛皮润亮，呈丝状光泽。鸟类中的灰头鹦鹉、大绯胸鹦鹉是云南的特产。鹦鹉不见于与云南同纬度的我国东部沿海各省，却在云南的横断山脉中被发现，而且数量很多。这说明，地形与山脉走向对动物的分布起着很大的作用。
2．华南系的动物。
本区系动物分布在滇西南、滇南和滇东南，尤其是靠国境线一带。这里的气候炎热多雨，植物生长茂盛，森林覆盖郁闭，层次重叠，适宜动物栖息。本区动物种类之多，在全国居首位。近年来还陆续有新的发现。
由于本区与中南半岛毗邻，山水相连，使中南半岛的不少动物延伸到这里，成为我国一个比较独具特色的动物区。例如，兽类中有灵长目的白眉长臂猿、懒猴、黑冠长臂猿、巴氏叶猴等特有种类。云南的白眉长臂猿，额头有一道白眉，雄的体为黑色，雌的为淡黄色或灰色。黑冠长臂猿，头顶上生长着冠状长毛。因为成年雄性毛色全黑，故又有“乌猿”之称。
本区的西双版纳等地，还生存着成群的印度象和稀有珍贵的野牛，这是我国其他地区少有的。
这一地区兽类中，还有一种食肉目的熊灵猫，简称熊猫。这种动物与大熊猫、小熊猫不同，身上的毛长而稀疏，样子和熊差不多。当地的傣族人因为熊灵猫的头像猪的。脚似狗的，所以把它称“狗猪”。熊灵猫分布不广，仅限于东南亚地区位于赤道到北回归线之间的炎热地带，如缅甸、泰国、越南、马来西亚以及云南南部。熊灵猫栖息于热带密林中，在树上生活，白天潜伏于树洞中，夜间出来活动。由于尾长和肌肉发达，下树时，先将尾倒挂在树上，再缓缓落地。熊灵猫除吃鸟兽、昆虫外，也吃野果。本区兽类还有食肉目的椰子猫、花面灵猫、斑灵猫、灵猫、点斑林狸、莽猫、印度水獭，翼手目的长舌果蝠、墓蝠，食虫目的毛猬、长尾猥，鳞甲目的印度穿山甲等。
鸟类有鹦鹉、太阳鸟等。尤其以热带种类的居多，如绿孔雀、蓝孔雀、双角犀鸟、双辫八色鸫、黄胸织布鸟、蓝背和平鸟等。这些鸟，大都有绚丽的羽色，适应色彩缤纷的热带植物环境，为我国其他地区所少有。