背诵。寺院教育中要求凡是主要的，或者根本性的经典都要背诵，尤其初学者背诵是主要的学习方法。背诵必须要达到十分熟练的程度，每一章每一节都记得十分清晰，方可在辩论的时候，对答如流。扎仓还要进行背诵面试，如果没有背会规定的页数，就要罚去做体力活。这种背诵的学习方法，使格鲁派的许多僧人都有非凡的记忆力，”五部大论”全在自己的脑海中。
辩论。通过辩经来学习是格鲁派寺院最为主要的学习方法，这也是古代印度佛教的传统。凡正规的学期中，每天早、中、晚有三次辩论学习，在寺院的法苑（又称讲经院）中进行。如拉卜楞寺，早上各班级按次序坐在大经堂门外广场，十三级的在最前面。本级僧人之间两人为一对，一个人提问，另一个人回答。如果没有对手，则须向监督报告。中午辩经，也在讲经院，低年级坐在中间。低年级的到高年级去辩论以求指导，高年级的发问，低年级者答辩。晚上辩经，高年级的二人到下级班中去辩论，由下级的级长或学习优秀的僧人提问。@辩论时，答辩者盘膝而坐，仰面目视提问者，聚精会神，准备应战。而提问者拍掌高呼，挥舞念珠，显示出各种傲慢的姿态。每日的三次辩经，不准缺席，如有事不能参加，则必须要请假。有时晚会的辩论中，双方辩得不可开交，以至于通宵达旦。”西藏喇嘛在学习经典上有他们的独到之处，并不光是靠死记硬背或请师父讲经开示，而最主要的是学习方式是在辩论场上通过辩论来彼此印证，互相学习，进而达到对于经论的理解和融会贯通。”⒂通过不断的辩论，加深了对经文的理解能力，最后做到了无论是一部著作的总的内容概述，还是具体的段落，甚至句子，都能了然于胸，完全通达，而非一知半解。
除了学经期间的辩论外，还有全寺性的辩论大会，在拉卜楞寺每年农历四月、十月的十九日至二十四日举行辩论大会，所有闻思学院的高僧和全体僧人都必须参加，答辩者为五年级至十二年级的僧人，提问者为各级级长、高僧、推选出的优秀僧人。答辩者由各级逐级轮流，该级僧人全体负责答辩，谁会谁答。西藏的三大寺有一个”绛饶堆冬季辩论会”，届时三大寺都选派平时学习较好的学僧，会聚在饶堆寺进行辩论，为时一个半月，集中辩论因明学知识。”每天大辩论，都是在露天大辩论场上，一二千人在那个荒山坡上，当展开辩论的时候，真有震憾山谷，惊骇禽兽的气势。”⒃不同寺院的僧人在一起辩论，更能互相促进。
寺院中的考试升级也采取辩论的方式，参加考试的僧人，必须熟读所考课目，通达经义，口辩没有任何错误者，方可升级，否则会给予一定的处罚。如果答辩时漏洞百出，不能自圆其说时，则会引起大家的哄笑。
4．格西学位
格西，意译善知识，佛教中凡对品学兼优者之尊称。藏传佛教中，格西又成为学位的名称，并分为不同的等级。西藏三大寺的格西学位分为四个等级：第一等拉然巴格西学位，第二等措然巴格西学位，第三等林赛格西学位，第四等为多然巴格西学位。
第一等拉然巴格西，其名称意思是指在拉萨取得的格西。首先参加考取拉然巴学位的学僧是所在寺院进行初试后推荐出来的最优秀的僧人，每个显宗学院有两个名额，三大寺共有十六个名额，有些年份名额有增加至二十个左右。扎仓的考试中，要求考僧对”五部大论”各立宗答辩五次，必须对答如流，不能出错，只有精通”五部大论”者才能胜任。通过扎仓考试的学僧，还要在寺中有数次答辩，包括到各自的康村和冬季全寺性的法会上进行辩论。之后，有两次重要的复试。第一次在正月祈愿法会前一年的夏季，拉然巴格西的考僧到罗布林卡复试，每位考僧分别配以一位著名的学者，相互间进行对辩，达赖喇嘛亲自听取辩论，其经师和其他高僧出席做评判。主考人员根据考僧的答辩水平排出名次，其中的前两名，到次年的藏历正月初一受邀至布达拉宫参加宴会，并还要对辩经义。最后一次复试是在正月祈愿大法会上，在大昭寺的讲经院立宗答辩，每天考试1—2名。早上考《释量论》，中午考《现观庄严论》和《中论》，三大寺的格西及研习此三论的学僧与其共同辩论，一般本寺的高僧不能对本寺的应考僧人发问。辩论的场面宏大，前来观看的人密密麻麻，考僧必须流利地回答而且有根有据。到了晚上进行《俱舍论》和《戒律本论》的答辩，难度很大，因提问者是上、下密院的高僧、甘丹寺两大经院的法主和三大寺的堪布，可谓高手如云，如果没有真才实学是难以应对的。待法会结束后，公布获得一等格西的名次和无名次的拉然巴格西名单。一般只计前七名的名次，达赖喇嘛还要给每位格西颁发奖品。拉然巴格西的考取难度极大，在藏族社会也备受尊崇。
第二等措然巴格西学位，措然巴的字面意思是在”全寺性的集会上取得的格西学位”，措然巴格西学位的定额三大寺共为10—12名。也是经过各学院的辩经考试而推选出来的优秀学僧，个个都是精通五部大论的。措然巴的最后考试是在藏历二月法会上，该法会是为纪念五世达赖喇嘛圆寂而设立