，彰显佛陀为利益众生而不惜自己生命的精神，为后世的学佛者树立楷模。本生类故事极富感染力，在佛教信徒中广为流传，亦具有道德教化功用。除六论外，噶当派十分注重中观、慈氏五论、俱舍、因明、戒律等学，可以说大小乘佛教显宗的最主要的学说都被噶当派所继承。
噶当派的佛学思想体系和对整个佛教的大小乘、显密关系的认识，主要体现在阿底峡尊者的《菩提道炬论》中（又译为《菩提道灯论》）。阿底峡赴西藏之时，西藏的佛教界在佛教的见、行、显密关系等方面有许多错误的认识，各行其是，各执己见，修习不规范。阿底峡大师抵达西藏后，古格的绛曲沃等人向阿底峡请教，请求尊者消除众人的疑惑不解之处，主要问了七个问题，其中两个属于共通乘（包括大小乘），两个属于大乘，三个属于金刚乘。为此，阿底峡造《菩提道炬论》本文及注释。《菩提道炬论》本文共有六十九颂半，却涵盖了显密大小乘的重要义理，概括了两大车轨师（即龙树、无著）的传承教诀，词简而义严，解答了当时西藏佛教界的疑难问题。宗喀巴大师评论道：”依怙（指阿底峡尊者——引者）所造，虽有多论，然如根本极圆满者，厥为道炬。具摄经咒（经指显宗，咒指密宗——引者）所有枢要而开示故，所诠圆满。调心次第为最胜故，易于受持。又以善巧二大车轨，二师教授而庄严故，胜出余轨。”⑥并总结阿底峡的此道次第教法有四大殊胜：通达一切圣教无违殊胜，一切圣言现为教授殊胜，易于获得圣者密意殊胜，极大罪行自趣消解殊胜。
《菩提道炬论》将学佛者分为三类，即下士、中士、上士。下士惧怕轮回的痛苦，但只追求自身的快乐，希望转生为人或天而止恶行善者。中士者畏惧三界六道轮回之苦，遂不做诸恶行，希求个人的解脱。上士者则从自身苦，想到世间一切有情的痛苦，决心为消除一切众生的痛苦而修行，”若以自身苦，比他一切苦，欲求永尽者，彼是上士夫。”⑦因论述三士夫修行的次第，因此被称为”菩提道次第”，”灯”或”炬”者喻此论如光明能消除黑暗。
就《菩提道炬论》所讲述的修行内容而言，大致分为五大部分：
第一，皈依三宝，即信仰、供奉佛法僧三宝的礼仪。
第二，论说发愿菩提心和行菩提心，愿菩提心即为利益众生而追求佛果的愿心，行菩提心即受菩萨戒，遵循菩萨的行为轨范。
第三，论说修禅定引发神通，而广作利众事业，云：”如鸟未生翼，不能腾虚空，若离神通力，不能利有情。”⑧
第四，论说般若、方便，成佛要积智慧和福德二种资粮，般若即智慧资粮，要通达中观缘起性空之理。方便即福德资粮，包括布施等一切善行。”般若离方便，方便离般若，俱说为系缚，故二不应离。”⑨智慧方便共运方可成就佛位。
第五，论述密宗的修行，修密法者要依上师受灌顶，方可如法修习。特别指出梵行者（指受戒的佛教僧人）不能受无上瑜伽部的秘密灌顶和智慧灌顶，”倘持彼灌顶，安住梵行者，违犯所遮故，失坏彼律义”⑩。从而也解答了西藏学者对此问题的错误认识。
《菩提道炬论》言简意赅，廓清了当时西藏佛教界存在的诸多谬说，也为噶当派树立了完备的教法体系。噶当派的历代大师多有《菩提道炬论》方面著述，并形成了不同的传承系统。后来，这一佛学体系被格鲁派继承并发扬光大，《菩提道炬论》也一直在格鲁派僧人中得到传诵。
菩提道次第中修菩提心是关键，噶当派十分重视修菩提心，并有修心方法，由阿底峡传仲敦巴，仲敦巴传三昆仲，之后逐步得到广传。噶当派的不少大师对修心方法进行高度概括，以口诀形式传承，如朗日塘巴总结为八段，称为”朗日塘巴修心八法”，其内容为：
我于一切有情众，视之尤胜如意宝，愿成满彼究竞利，恒常心怀珍爱情。
随处与谁为伴时，视己较诸众人卑，从心深处思利他，恒常尊他为最上。
一举一动观自心，正当烦恼初萌生，危害自与他人时，愿疾呵斥令消除。
秉性邪恶众有情，恒为猛烈罪苦迫，见时如遇大宝藏，愿恒惜此难得宝。
他人出于嫉妒心，非理辱骂谤我等，粗恶秽言我取爱，愿将胜利奉献他。
吾昔饶益助某人，且曾深心寄厚望，彼虽非理妄加害，愿视彼为善知识。
无论直接与间接，愿献利乐于慈母，如母有情诸苦患，我愿暗中自取受。
愿此一切我所行，不为八法念垢染，以知诸法如幻智，无执离缚而解脱。⑾
修菩提心就是修慈悲之心，就是修利益他人之心。对一切生命都深含珍爱和怜悯之情，身心充溢着对他人的爱。一切的愤恨、贪恋等心理状态被摧毁，不为世间的誉毁利害所动，身心打破了世俗观念的束缚而获得自在。菩提行者身上散发着温和而慈祥的光芒，善念和善行自然而生。菩提心的修炼，使心灵得到净化，实现道德上的完美，也完全体现了大乘佛教的利他精神。
另有切喀巴的”修心七法