从6月25日到6月28日，为清廷第一次停攻使馆。6月26日，因围攻使馆有功，也是为了安定对朝廷停攻使馆愤愤不平的情绪，清廷奖赏董福祥部甘军和义和团。
从6月29日起，义和团和清军再攻东交民巷公使馆。7月1日，董福祥督军猛攻使馆，无大进展。清军和义和团攻击公使馆，虽然攻势不大，但荣禄仍然甚为担心，于7月7日再次恳求慈禧太后下令停攻使馆。慈禧尚未答复，7月8日，董福祥及义和团又对使馆发起猛攻，击毙奥军官（Thomann）一名。7月12日，身处南方的李鸿章和张之洞等致电奕勖、荣禄等，请停攻使馆，保护各国公使安全。同日，太常寺卿袁昶也上奏，请速保护公使馆，以维持大局。
庆亲王奕勖和军机大臣荣禄立即行动，与各国公使谋和。7月14日，奕勖和荣禄再次致书英国公使窦纳乐，要求各国公使移居总理衙门，然后护送出京。各国公使认为，固守待援，远比远赴天津安全，于是窦纳乐在次日复电拒绝。16日，庆亲王奕勖等又致书窦纳乐，商议停战一事。17日，清廷又致书法德美三国，请求调解。这期间，荣禄等不断派人与使馆秘密接触，希望各国公使出面斡旋，同意议和。
7月17日，清廷第二次下令停攻使馆。此次停攻，一直延伸到7月28日。次日，总理衙门派人到公使馆；表示一定要保证各国公使的安全。7月19日，庆亲王奕勖等又致书各国公使，仍请暂时避居天津，总理衙门将派宋庆和孙万林两军护送，否则，若有不测，总理衙门不能负责。各国公使拒绝。7月20日；总理衙门以面粉、蔬菜、冰和瓜果之类的生活必需晶赠使馆，以求缓和。7月25日，奕劻仍请各国公使赴天津避难。26日，奕勖再以瓜果食物等赠使馆。
7月29日，董福祥部和义和团再攻使馆。奕勖大惊，赶紧上奏停攻使馆，同时向使馆声明以后不敢再有围攻之事，并再催各国公使赴津避难。
8月3日，清廷第三次下令停攻使馆。
然而，八国联军完全拒绝议和。从8月4日起，约1万8千人的八国联军白天津向北京节节推进。4日，联军打败裕禄、宋庆、马玉昆等军，占领北仓；6日，攻占杨村，裕禄自杀；7日，攻占蔡村，败李秉衡；9日，攻占河西务，李秉衡再败退；11日，攻占张家湾，李秉衡自杀；12日攻占通州；13日，八国联军逼近北京，当日俄军攻占北京东便门。北京转瞬即破。
8月5日，当清军和义和团得知八国联军已由天津向北京攻击前进之后，立即起而围攻公使馆，目的是拘捕各国使臣，作为人质。8月13日，八国联军在城外包围攻击北京，企图尽快占领北京，解救被困在公使馆的各国公使。而清军董福祥部和义和团则对公使馆作最后的猛攻，仍然希望在联军攻破北京内城前拘捕各国公使，以挟持八国联军。盘踞在公使馆的联军部队和各国公使，在这最后的时刻作困兽之斗，拼死力顽抗。
8月14日，八国联军攻陷北京，挺进公使馆，打散清军和义和团，解了公使馆之围。
清军和义和团围攻东交民巷公使馆的战斗，从6月20日开始至8月14日结束，历时56天，击毙联军43人，击伤联军及使馆人员152人，但自己的伤亡更大。慈禧太后的出卖，是公使馆久攻不下的根本原因。这个战斗，虽然对帝国主义的嚣张气焰有一定程度的打击，却违反了驻在国保护外交使节的国际交往准则和惯例。这是清朝封建顽固派有意将义和团反帝斗争引向盲目排外的歧路的结果。
沙俄侵占东三省
沙俄早有吞我东北野心，时刻窥伺时机。1900年初，华北地区义和团运动高涨，东北地区义和团也不断拆铁路焚教堂杀教士。东北教会势力主要是沙俄的东正教，义和团运动的兴起，打击了俄国在东北的侵略势力。俄国乃决定借机出兵，吞并东北。
沙俄财政大臣维特声称：在中国东北，只要有10万至15万军队，就能把中国打得粉碎。
6月17日，八国联军攻占大沽口炮台。23日，俄国宣布与东北接壤的阿穆尔军区和西伯利亚军区的部队进人战争状态，开始紧张的战争部署。到7月初，已动员部队11．6万多人，组成4个军团，做好了进攻中国东北和华北的准备。沙俄的军事计划是：以旅顺口为基地的西伯利亚第一军团，负责夺取大沽、天津和营口，进逼北京和盛京（沈阳）；以伯力为基地的西伯利亚第二军团，作战方向是哈尔滨，占领哈尔滨后，迂回包围盛京；由阿穆尔军区部队右翼组成的西伯利亚第三军团以斯列田斯克为基地，从呼伦贝尔城（海拉尔）和海兰泡两个方向直趋齐齐哈尔，攻占齐齐哈尔后，也迂回进攻盛京；阿穆尔军区部队左翼组成登陆军团，以海参崴为基地，作战方向是宁古塔、吉林，最后目标同样是盛京。在上述四路军队中，旅顺口、海兰泡和伯力三路为主力。为便于军事指挥，沙俄政府将北直隶和南满战场（旅顺口至盛京）交给关东地区部队和太平洋海军司令官阿列克谢耶夫中将指挥，将北满战场（吉林、黑龙江两省）交给阿穆