该校聘请日本著名军事专家日野熊藏为校长，以退役军官小室健次郎为助教，除教授日语等普通课程外，着重传授给学生军事知识及枪炮火药的制造方法，尤其注重布尔人的散兵战术及以寡敌众的夜袭法。该校先后有学生14名。入学者须先填写盟书以明心迹，并要举行宣誓仪式，誓词为“驱除鞑虏，恢复中华，建立民国，平均地权”，取代了兴中会原来的“驱除鞑虏，恢复中国，创立合众政府”的誓词。后来孙中山离开日本，该校因内部纠纷，仅存在约半年即停办。
《香港政府公报》发表接收新界的报告书。《香港政府公报》于本日发表接收新界的报告书。在该报告书中，有关治理新界的内容如下：关于治匪工作，现经调遣陆军分驻一带要冲，并充实警队守护力，军警通力合作，联队出任逡巡，并在大埔墟设总警署，敷设电话，与香港九龙各警署联络……关于治民工作，新界全部地方划分8区47分区，乡村耆老德望所归的，委为各区长老，担负约束子弟的责任，遇到纠纷事件有审判的权力，由辅政司驼克统制监督。
9月1日。清廷以大学士崇礼为国史馆总裁官，以兵部尚书裕德为翰林院掌院学士。
王乱刀子、何裁缝等在陕西洛河太白庙聚众1000余人，打出“攻打教堂、尽杀教民”的口号，开展反教活动。
开平矿务局督办张翼致函外务部，称已派洋员庆世理前赴英国诉讼开平矿权。
9月2日。荣赫鹏复函英印政府要求向西藏增派兵力。英印政府去函征询荣赫鹏的意见，荣赫鹏在复函之中提出了自己的建议，其主要内容如下：
（一）添拨援军100名到干坝，以补充“卫队”；
（二）将英印工兵第23队集中于则利拉山一带；
（三）设法向西藏地方当局表明，尼泊尔已臣属英国，而不属于藏人。
《中外日报》转载《泰晤士报》上所刊《西报志各使议<苏报>事》一文，披露了法、俄公使主张将《苏报》案6人引渡给中国政府，英、美、日等国公使反对引渡的内幕。
英使要求英兵船进入鄱阳湖被外务部拒绝。驻华英使于本日照会外务部，声称近来英国兵船前往鄱阳湖时被炮台官阻止，这不符合《烟台条约》的规定。外务部以《烟台条约》中的条文并非针对兵船而言，理应禁止为由，答复英使，要求他们不要前往，以有利于双方的睦谊。
9月3日。驻俄日本公使栗野慎一再次拒绝俄国提出的将谈判地址移往东京的要求。俄国政府则表示，俄日两国有关中国东北问题的谈判，不能久以日本提案作为谈判基础。
9月6日。俄使向清外务部提出5项修正条件被拒绝。本年3月21日，俄国驻华公使普拉嵩为满洲第二期的撤兵问题向清政府外务部提出7项要求，遭到英美日等国的反对，同时也导致了中国拒俄运动的兴起。于是，本日俄使向外务部提出5项修正条件：
（一）交还之区域，不得转让于外人。
（二）俄国在松花、黑龙两江沿岸及齐齐哈尔到海兰泡的大道上设置兵站。
（三）保障东清铁路的商业利益。
（四）中国派兵保护俄华银行。
（五）营口卫生局应有俄国医生参加防疫。这五项修正条件与3月21日要求相比虽已有所和缓，但始终没有改变其妄图独占东三省的这一主旨。清政府外务部以其妨碍中国主权以及违犯列强的门户开放政策而对此加以拒绝。
魏光焘奏报关于张之洞订购长江浅水新式快船事宜。前署理两江总督张之洞曾奏请订购长江浅水新式快船，清廷令两江总督魏光焘复核妥办，经过考察，魏光焘将意奏汇报给清廷。他奏道：“伏查南洋滨海临江，口岸林立，巡防弹压，非有兵轮，不足以资镇慑。张之洞因南洋原有兵轮，多机老钢薄，式旧行迟，蚊船一项，又短笨濡滞，不适于用，分别裁停，节存薪费，另购新式浅水快船，以资分巡，而壮观瞻。复向东西两洋船厂，多方考较，又以日本川崎船厂开价较廉，遂与该洋厂分别订议。详加考核，所筹办法，实于江防饷需，两有裨益。惟事关订购军舰，考究不厌精详，当饬筹防局司道将原订合同清单，督同熟谙制船之员逐细核查，其中有声明增改各节及应添备各件，会同日本驻宁商务总办及日本川崎厂委员详加商定，于合同及清单内逐一添载，分缮汉、英文合同各三份，署名盖印，各执为据。”魏光焘对付款办法作了说明之后又说：“兹据该局详请核办前来，除按照合同无讹，再行照议续造三船，并咨外务部、户部、兵部、工部查照外，理合恭折覆陈。”
清廷仍令在黄河督建铁桥。关于在黄河修建铁桥一事，河南巡抚张人骏举奏了一系列可担忧之处，如河身沙松、土疏，立根不牢，凌讯时期河水暴涨，水即能漫过大桥等等。朝廷据他所奏，征求袁世凯、张之洞、盛宣怀的意见。他们认为在黄河造铁桥一事已经过详细的审查，对于河防并无窒碍，况且现在铁路为新政大端，桥工为南北关键，故仍请求妥慎督造，此意见得到清廷的认可。
9月7日