学生上禀管学代奏力争。会后分别发出：《京师大学堂师范、仕学两馆学生上书管学大臣请代奏拒俄书》，《京师大学堂师范馆学生请政务处代奏争俄约疏》、《京师大学堂学生公致鄂垣各学堂书》等。是为中国近现代史上大学生爱国运动之始。
5月5日。（光绪二十九年四月初九日）江苏巡抚为送书事知照大学堂：查江苏书局所刻经史子集计一百七十四种、图歌三种。遵饬每种各提四部。计共六百九十六部、图歌十二张……共分装十八箱，备批详解，察核验收，详咨派员运京交纳。
5月6日。（光绪二十九年四月初十日）江苏巡抚恩送梁延年编辑《圣谕像解》一百部咨京师大学堂。
5月16日。（光绪二十九年四月二十日）外务部复照大学堂：“本月十七日接准咨称：本大学堂汉文教习及编书局各员，现在手定课本，间有研究商务之处，需用光绪二十八年海关通商贸易总册……请调取数册，交送应用……查海关册，向由总税务司于每年年底将先年分总册申送本部，现经送至二十七年分止。所有贵学堂需用二十八年海关总册之处，应俟该税务司将此册送到，即由本部咨送可也。”
5月18日。（光绪二十九年四月二十二日）河南送吴庆嵩，王人杰、胡汝麟、时经洲等四名学生备大学堂考选。
5月21日。（光绪二十九年四月二十五日）京师大学堂上海译书分局总办、内阁中书沈兆祉呈送管学大臣《西洋伦理学史》等译稿十册、原书四册。
6月8日。（光绪二十九年五月十三日）大学堂知照顺天府，所送《顺天府志》一书已由藏书楼收存。
6月27日。（光绪二十九年闰五月初三日）张百熙等奏，“京师大学堂为学术人才根本，关系至重，考究宜详……张之洞为当今第一通晓学务之人……伏恳天恩，特派该督会同商办京师大学堂事宜，一切章程，详加厘定……”为此上谕：“张百熙等奏请派重臣会商学务一折……著即派张之洞会商张百熙、荣庆将现办大学堂章程一切事宜，再行切实商订，并将各省学堂章程一律厘定，详细具奏。”
6月。（光绪二十九年五月）京师大学堂医学实业馆开学。前此招生，投考者二百余人，定额仅取三十余名。
7月。（光绪二十九年六月）大学堂译学馆招生告示称：“京师大学堂于上年九、十月，经本大臣两次考取，速成科均已入堂肄业在案。现在开办译学馆，招选学生额定一百二十名，分习英、俄、德、法、日本五国文字，兼习普通科学，五年毕业……其考试仍分两场，第一场试以修身伦理大义一篇、中外史学六问、算学三问；第二场试以中外地理六问、物理学三问、外国文论一首或笔对数条……其年龄取自十六岁以外，二十二岁以内为限。今定于七月初一日考试头场，初二日考试二场……该生等务于六月二十日齐集京师……亲身赴本大学堂报到投考，统于六月二十八日截止……”
8月19日。（光绪二十九年六月二十七日）张百熙委派候选知县屠寄赴上海等处搜集各种新书，无论稿本、印本，但系宗旨纯粹有裨学堂实用者，随时呈核。
9月。（光绪二十九年七月）外务部为声复逐年拨交大学堂息银数目咨户部，请查核：光绪二十四年八月，拨交二十三年息银二十一万八千一百零七两四钱；光绪二十五年八月，拨交二十四年息银二十万两；光绪二十八年四月，拨交二十五、六、七年息银四十万两；光绪二十八年八月，拨交二十五、六、七年息银六十二万八千三百三十两二钱六分；光绪二十九年七月，拨交二十八息银三十八万二千二百八十三两五钱三分。
10月8日。（光绪二十九年八月十八日）大学堂知照湖南巡抚提运湖南善后局书籍十五种。
10月15日。（光绪二十九年八月二十五日）使日大臣蔡送《西伯利亚大地志》一部二本咨京师大学堂。
10月19日。（光绪二十九年八月二十九日）沈兆祉呈送管学大臣《博物学教科书植物部》等译稿十六册、原书四册。
10月23日。（光绪二十九年九月初四日）使俄大臣胡咨送大学堂译印《东三省铁路图》四幅、《悉毕利铁路简图》一幅。
12月3日。（光绪二十九年十月十五日）大学堂委派副总办姚锡光赴沪将各项书籍仪器近时价值详细采访，禀候察核。
12月21日。（光绪二十九年十一月初三日）军机大臣面奉谕旨：“本日张百熙等奏选派学生前赴东西洋各国游学一折，师范学生最关紧要，著管学大臣择其心术纯正学问优长者，详细考察，分班派往游学，余依议。钦此。”张百熙奏折称：“……亟应多派学生，分赴东西洋各国，学习专门，以备将来学成回国，可充大学教习……现就速成科学生中选得余荣昌……共三十一人，派往日本游学，定于年内起程；俞同奎……共十六人，派往西洋各国游学，定于年外起程……学期约以七年为率。西国十六人，统计需费十万余两；日本三十一人，统计需费九万余两，而川资等项尚不在内……”
12月。（光绪二