克唐纳率英军从江孜出发，长驱直入拉萨。8月3日，英军占领拉萨。
9月7日，西藏地方政府被迫与英方签订了《拉萨条约》。条款中隐藏着排斥中国对西藏的主权，建立英国对西藏的保护关系的阴谋。清政府觉察到了英国的险恶用心。1905年，清政府任命唐绍仪为全权代表，经过一年多的艰苦谈判，1906年4月27日在北京与英国签订了《中英续订藏印条约》（即<北京条约>）。
英帝国通过两次侵藏战争，攫取了种种在藏特权，为英国后来在西藏从事分裂活动提供了条件，同时给中国造成了严重的边疆危机，为以后中印边界纠纷埋下了祸根。内外交困的晚清政府虽然无力同英国抗街，但强烈的刺激促使清政府很快采取了开发西藏的系列措施，为西藏社会的发展打下了基础。
西藏民众殊死抗击英军的英勇行为，打击了侵略者的气焰。西藏人民面对强敌入侵所表现出来的不屈不挠的斗争精神将永远铭刻在中华民族的史册中。