恩说：“臣听说管仲曾对齐桓公说：‘愿君不要忘记射钩之仇，臣不要忘记槛车之辱。’齐国这才因此强盛起来。臣今天也希望国家不要忘记河北的艰难，臣也不敢忘记陛下在巾车乡的恩情。”冯异在京城停留了十多天后，刘秀就让他带着妻子儿女返回了关中。
就在冯异回去的同时，申屠刚和杜林两人从隗嚣那里来到了朝廷，刘秀就任命他们为侍御史，随后又任命郑兴为太中大夫。
本年三月，公孙述就派田戎从江关出发，沿途招揽旧部，想要攻取荆州，但是没有成功。刘秀于是就下诏给隗嚣，说他打算从天水出兵伐蜀。隗嚣却上书说：“白水关道路险阻，加上栈道又被毁坏了，所以很难通过。公孙述性情严酷，导致上下离心离德，我们应当等他罪恶昭彰时再进攻，这样才会有一呼百应的效果。”刘秀知道隗嚣最终不会为自己所用，所以就开始谋划讨伐他的事情。
到了夏季四月，刘秀就前往长安，去拜谒汉朝先祖的陵墓；又派了耿弇、盖延等七位将军借道陇西讨伐蜀地，他先派中郎将来歙带着朝廷的玺书去劝谕隗嚣。可隗嚣还是犹豫不决，事情就被拖延了很久。这时，来歙就愤怒地质问隗嚣说：“陛下认为你是一个明辨是非的贤士，能够懂得兴盛和废驰的道理，所以陛下才亲自写信表达自己的诚意。你既然已经派了隗恂入朝为人质，那为何还要听信谗言，做出灭族的打算？”说完，来歙就想要刺杀隗嚣。结果隗嚣起身躲入了内室，又命令士兵包围了来歙，最后来歙手持符节从容地登车离去。看他这么嚣张，隗嚣就派牛邯率兵围住了来歙。隗嚣的部将王遵劝谏说：“来歙虽然是一个人来出使，但他是陛下的表兄，若是杀了他，不仅对汉朝没有损失，反而会为我们招来灭族之祸。当年宋国扣押了楚国的使者，结果招致了析骸易子的惨祸。小国尚且不可侮辱，更何况是万乘之君呢？再说了，隗恂的性命可还在汉朝手中呢！”来歙为人恪守信义，言行一致，游说时都能按照事实说话办事；西州的士大夫都非常的信任敬重他，很多人都为他说话，因此他才得以安全东归。
五月，刘秀就从长安返回了洛阳。
最终，隗嚣还是发兵反叛了，他派王元占据陇坻，又砍伐树木堵塞住了道路。诸将与隗嚣进行了一场大战，结果没打赢，于是就各自率兵退下了陇山；隗嚣着急忙慌的去追击，结果遇到马武挑选的精锐骑兵断后，斩杀了数千人，诸军这才得以安全撤回。
到了六月，刘秀就下诏说：“朝廷设立官职和任命官吏，是为了服务百姓的。如今百姓遭受了灾难，导致人口减少，而县级官吏的职位设置还是很多。现在命令司隶校尉和各州牧核实所管辖区域的人数，要减少官吏的人数，要是有县和侯国中的人数达不到设置长吏的标准，就应该合并在一起。”这番操作下来，直接合并了四百多个县，导致官吏的职位大幅减少，只保留了原来的十分之一。
本年九月，天象发生了日食。
这时执金吾朱浮就上疏说：“过去尧、舜盛世时，官员尚且经过三次考核；到大汉兴起时，官员也是通过长期积累功绩，才能够长期任职，甚至传到子孙那里。当时的官吏职位，怎么可能全都治理得当？议论的人难道不会喧哗吗？这是因为天地的功业不能仓促的完成，想要完成艰难的事业就需要日积月累。而近来的地方官员频繁更换，地方官吏们迎新送旧，导致他们在路上疲于奔波。现在考察官员的任职时间都很短，根本没办法显示他们的能力，再加上严厉的考核制度，人们根本无法自保，又迫于举报和弹劾的压力，还害怕被批评，因此他们就争相伪装以追求虚名，这正是导致出现日食的原因。事物突然生长的必然会夭折，功业仓促完成的必然会迅速衰败。如果摧毁长久的事业而追求速成的功绩，这不是陛下的福气。希望陛下把眼光放长远，期待治理成果在一世之后显现，天下将非常的幸运！”刘秀觉得他说的有道理，就按他说的办了，从此地方官员的更换就变得简略了。
本年十二月，大司空宋弘被免职。
过了几天，刘秀就下诏说：“近年来战争一直没停过，国家的财政收入也严重不足，因此就实行了十分之一的税收。如今粮食储备有所增加，现在命令各郡国按旧制收取田租，税率为三十分之一。”
新的税收政策开始实行后，就迎来了一件喜事，那就是陇地被攻下来了。随后，刘秀就命令耿弇军队驻扎在漆县，冯异军队驻扎在栒邑，祭遵军队驻扎在汧县，吴汉等人则是返回长安驻守。当冯异大军还没有到达栒邑时，隗嚣乘胜就派王元、行巡率领两万多人下陇山，又分派行巡前去攻取栒邑。冯异得知消息后，就立即率军抢先占据了栒邑，这时的将领们说：“现在敌军强大而且乘胜而来，我们不能与他们进行正面交锋，应该停止进军，选择有利的地形，然后再慢慢谋划进攻的策略。”可冯异说：“现在敌军逼近边境，是为了贪图一些小利益，因此才打算深入；如果他们攻下栒邑，那三辅地区的统治根基将会被动摇。现在进攻者力量不足，而防守者却有余力。现在我们先占据城池，以逸待劳，这不是为了争胜。”于是就派人秘密前往，关闭了城门，又隐藏起了旗帜和鼓