多在人体正气不足、御邪能力下降之时，外感六淫，或有疮疡毒邪内侵，致风湿毒邪伤及肺、脾、肾三脏。风湿毒是该病发生的主要外因，病变脏腑主要在肺、脾、肾三脏。证候演变趋向是从表及里，由上焦、中焦而达下焦，从实向虚实夹杂演变。急性水肿期以邪实为主，而水肿消退期则进入正虚邪恋阶段。若失治误治，亦可上凌心肺，五脏俱病，变证丛生，或肺、脾、肾三脏俱虚，正不胜邪，病久不愈，迁延难治。因此，在辨证治疗中应注意扶正祛邪，标本兼顾，维护肾气的原则，切莫因急性肾炎而忽略个体差异，对体虚正亏的患者要注意扶正。肾虚有腰酸乏力诸症，根据辨证以六味地黄丸、金匮肾气丸、右归丸、左归丸等加减使用；肾虚湿热下注者，选用知柏地黄丸合滋肾丸、独活寄生丸、三妙丸等加减治疗；有表证发热者加金银花、蒲公英、连翘；浮肿者加茯苓、猪苓、冬瓜皮、大腹皮、泽泻、车前子等；尿少有肾功能不全者可加用大黄。
2.重视诱因的治疗，防患于未然中医学认为本病的发生多与感受六淫或疮疡毒邪有关，如能对先发疾病控制及预防，则能提高急性肾炎的治疗效果，防患于未然。临证之时，可根据外邪性质、侵犯部位的不同，随证治之。风热犯肺，病邪轻浅者，可用桑菊饮轻宣肺气；重者可予银翘散酌加大青叶、板蓝根、前胡、射干、马勃等以疏风解表、清热解毒；热毒较甚者，可用清瘟败毒饮化裁以清热解毒。风寒束表者，可酌情选用麻黄汤、桂枝汤、三拗汤等以疏风散寒，发汗解表。痰热壅肺者可予麻杏石甘汤、千金苇茎汤化裁。湿毒内盛者，可予五味消毒饮合甘露消毒丹加减，以清热、利湿、解毒。
还可在精确辨证的前提下，适当参合现代中药药理成果，精选药物，合理组方，以提高疗效。现代中药药理学研究表明许多中药对病原微生物具有一定的抑制作用，例如麻黄、桂枝、紫苏、柴胡、青蒿、前胡、茵陈蒿、黄芩、大黄、黄连、胖大海、赤芍、射干、鱼腥草、连翘、紫菀、升麻等均对流感病毒有抑制作用；紫草、贯众、野菊花、赤芍、虎杖、射干、甘草等可抑制疱疹病毒；虎杖、贯众、射干等可抑制腺病毒；虎杖、射干、淫羊藿等对柯萨奇病毒有一定的抑制作用；虎杖、贯众、赤芍、淫羊藿、桑寄生等可抑制肠道病毒；五味子、黄连、黄芩、黄柏、大黄、厚朴、木香、千里光、大蒜、仙人掌等具有抗葡萄球菌的作用，等等。
3.恢复期间，注重血尿与尿蛋白血尿、尿蛋白是急性肾炎最主要的临床表现之一，顽固性血尿、尿蛋白往往是急性肾炎恢复期的治疗难点。对于血尿的治疗在辨证的基础上，可重用两类药，一类是清热凉血利尿药，如白茅根、茜草、大小蓟、仙鹤草、三七、益母草等；另一类是活血散瘀药，如红花、丹参、蒲黄、赤芍、泽兰、桃仁、紫草等。正确合理地选用这些药物，常可有效地控制血尿效果。尿蛋白不易消退者加黄芪、芡实、白果、石韦、金樱子等。