亡政权兼并了车师前国，在高昌立稳了脚跟，第一次统一了吐鲁番地区，建立了历史上第一个独立王国。从此高昌从郡过渡到国，其建制也向国的建制转变。吐鲁番地区的历史，开始了改天换代的新纪元。公元640年唐统一高昌，在此置西州，下辖五县，高昌自此进入了繁华昌盛的最佳时期。9世纪中叶以后，回鹘人在此建立了回鹘高昌王国，随着铁木真的崛起和蒙古国的建立，铁木真被尊为成吉思汗。成吉思汗发动了规模巨大的西征运动，征服了从蒙古高原直至中亚的广袤地区，高昌回鹘亦都护巴而术阿而忒的斤见时机成熟，便于1209年谋杀了西辽王朝驻高昌的使者，正式脱离了西辽的监护，归顺于草原上新兴起的势力强大的蒙古帝国。《蒙古秘史》记载了亦都护归顺成吉思汗的过程:委吾种的主“亦都兀惕”差使臣阿惕乞剌黑等来成吉思处说:“俺听得皇帝的声名如云净见日，冰消见水一般，好生喜欢了!若得恩赐呵，愿做第五子出气力者。”成吉思说:“你来，女子也与你，第五子也教你做。”于是“亦都兀惕”将金银珠子段匹等物来拜见，成吉思遂将阿勒阿勒屯名的女子与了。 高昌都城虽然保住了，但高昌回鹘王国从此一蹶不振。从13世纪亦都护纽林的斤(公元1308年~1318年)时起，高昌回鹘一直忠于元朝皇室，与蒙古西北诸王笃哇之乱作战，为了躲避叛乱势力，元朝大汗忽必烈决定将高昌“亦都护”治所从高昌迁往哈密。可不久哈密城被攻下，高昌“亦都护”率部逃入嘉峪关内，高昌王国也已名存实亡。 察合台汗国建立后，首领秃黑鲁·铁木尔汗首先成了信奉伊斯兰教的蒙古汗王，他统治下的察合台汗国，也就成了伊斯兰汗国。为了维护自己的统治，察合台汗国武力推行伊斯兰教，借力征战，终于征服了高昌回鹘王国。而落入“圣战”者手中的高昌城也在战火洗礼中变成了一座废城。 虽然一座城消失了，但气势和规模还在，在故城里徘徊，可以想象昔日鼎盛时的旗帜飘扬，战马嘶鸣的景象。一场场的战火结束了，那些远去的灵魂还在怀念昔时的繁华，可我们只见到这样的废墟。孤凉的楼台遗迹好像还有王家游宴之盛，模糊的壁画佛影似乎犹闻梵呗齐鸣，残损的高城厚壁仿佛还在藐视千军万马，蒙尘的里巷民宅犹自回荡百姓的喧嚷...... 作品中的高昌是有温度的，不是铁血的高昌。