在基地内部还有一个巨大的实验室，这个实验室是仿照庐山生物研究所建造的，各种消毒、隔离措施一应俱全，并且各种超常规实验条件配备齐全。
吴辉是打算把逍遥岛当作老窝的，这里自然是阿米巴重点建设地域，逍遥岛上的所有植被和动物都被替换成阿米巴，就连附近的海域生物也全部被替换掉，这里被建成为首个全阿米巴组成的生态环境。
为了日后的人身安全计，吴辉在岛上关键建筑里做了不少手脚，很多建筑悄无声息的被替换成阿米巴结构。在一些关键位置，阿米巴会像是腐殖细菌一样，以钢筋混凝土为食，把它们一点点侵蚀掉，然后自己填补进去，虽然从外表上看不到任何变化，实际上整个建筑已经慢慢变成一座标准的生物建筑。
阿米巴在吸收足量的金属离子之后，可以变成强度可比钛合金的高强度生物组织，这个特性被吴辉利用起来，将很多关键性建筑变成比军事堡垒还要坚固的阿米巴生物堡垒。
有海底采矿基地的支持，大量稀有金属被输送到逍遥岛，悄悄变成各种建筑物的墙体、立柱、支撑结构。