在帝国生物工程学院，博士找到了他梦寐以求的工作——西林教授的实验助手。
一个偏激的人可能会失去思考的本分，但是两个偏激的人，却能在争吵间不断思考。
亦师亦友的两人每日都沉溺在宇宙的灿烂和永恒之间，直到西林博士被帝国一个神秘的科研项目所征调，他在临走时，特意在助手的名额上填上了博士的名字。
“盖亚！”
这时候，这个词才第一次出现在博士的脑海中，自此再也挥之不去，如同梦魇，每日折磨着博士的脑神经。
在这个实验中，博士的天赋被发挥的淋漓尽致，各种天马行空般的想象都被他应用上，随着时间的推移，老一代人的大脑迟钝后，博士成为了新的实验领导人。
整个实验都按照他指挥的方向进行，所有的工作人员都遵从他的指令，帝国每年有三分之一的资源被他调用，可谓是大权在握。
他不顾成本的实验着他的各种想法，他减少了睡眠，每天只有不足三小时，剩余的时间都在实验室渡过，他设计过的实验，若是转换成A4纸存储，足足都有百米之高！
在这期间，他的助手被他守卫徒弟，虽然他平没有教导过这个徒弟任何东西，但是这个名为PDD的助手却一直保持着应有的尊敬和对生物进化的憧憬，这让他很满意。
然而，几十年后，当PDD的一封邮件发送到他的邮箱时，他才明白他的这个曾经的助手，名义上的徒弟都做了什么，才明白外面的世界已经开始了变革。
曾经辉煌的帝国已经日落西山，再也没有取之不尽的资源供他使用，实验的资金也已经赤字，他这才意识到，实验将不能维持下去。
而可怕的事情发生了……基地中的人开始了异变！