式成为国家这个整体之前，曾经接受过我国的两次册封。一次是大汉朝光武皇帝，一次是大魏朝文皇帝。在陈寿作《三国志—魏志—倭人传》上可见到关于魏文帝对倭国进行册封的记载。而当时的倭国，则刚刚经过了以出云的於投马与筑紫的邪马台二国为主的持续十数年的“倭国的大乱”。在须左之男死后，邪马台收复失地，并成为了当时日本岛上最强大的部族，接受魏文帝册封。日本也就是在此之后，进入“神武东征”时代，开始向一个统一的岛国过渡。
在此之前的有关日本历史的记载，主要见于《古事记》与《日本书记》二书。而这两本书则充满了神话色彩，与《荷马史诗》颇为相似。但前二者的神话色彩却要浓重的多了。当今研究日本古代史的学者，也被这两本记叙当时事件以神话为主，且模糊不清，没头没尾的书弄的大伤脑筋。并且其中并没有有关邪马台与卑弥乎的记载。而其关于日本创世的记载却还是颇有趣的。
日本号称本国有八百万神，连桌子角、椅子背都有一位神明掌管。而在创世之前，则只有三位神明。此三人在最初的记载中，说是出现在高天原。为天之御中主神、高御产巢日神、神产巢日二神。在这三位神明诞生后，其他也陆续有神明开始诞生。而最初三位神明中，在现在日本广为祭祀的却是高御产巢日神与神产巢日二神，而天之御中主神却遭受冷落，甚至在《古事记》书中也是如此。而高御产巢日神在此后的很多重要神话事件中都颇为活跃，且与大国主、建御雷等都颇有瓜葛。
在很多神明诞生后，被日本人认为真正先祖的神明诞生了。那就是伊邪那歧与妹妹伊邪那美。此二人降世的使命就是产神，既诞下此后的无数神明。
传说中伊邪那歧站在云桥之上，手持天诏矛，矛上滴落的露水落到下界，形成了一个叫做淤能基吕岛。现在学者尚不能确认此岛究竟是后来的哪一个岛，因此只能暂定此岛为虚构的。此二人降世后，虽然是兄妹却背负产神的任务，于是便发生了性关系。但他们的第一个孩子是个叫“水蛭子”的没有骨头的孩子，于是二人只好将他放在芦苇编织的小船中，让他随波逐流……之后的几次也都失败了。产下的全是乱七八糟的东西。于是二人只好求助于高天原的神明。而神明给他们的启示则是——**过程中女方不能过于被动。似乎日本的神明也和日本人一样，满脑子XX ……
两人回到下界后，便开始欢快的交合。于是相续产下了四国岛、淡路岛、筑紫岛、左渡岛等大大小小的岛屿。此后又开始了生育各样的神明。这个过程中，产下的神有绵津见之神、大山津见等主要神明。最后在产下火神迦具土时，伊邪那美烧伤了**。没办法，因为是火神嘛……此后伊邪那美得了重病，但仍然在不停的产神，最后有些神明竟然是从他的呕吐物与排泄物中化成的……真他妈恶心。
在产下大部分神明后，伊邪那美因为重病而死去了。伊邪那歧悲痛莫名，于是斩杀了烧伤伊邪那美**的迦具土。而迦具土剩下的尸体与流出的血液中又化出了很多的神明。伊邪那歧将伊邪那美的尸体放在出云的比婆山中，然后就前往了黄泉寻找死去的伊邪那美。
在黄泉死者之国的神明答应了伊邪那歧的请求，但是要求他答应在回到生者之国前不许偷看伊邪那美的模样。伊邪那歧满口答应，可是后来却忍不住手持蜡烛在栏杆旁偷看了伊邪那美。但他看到的却是早已面目全非，只剩一张只剩腐烂尸肉且爬满蛆虫的脸孔。伊邪那歧被吓得惊惶逃跑，而伊邪那美追上他，并对他的失信进行谴责，且发恶誓，每天必定杀死一千人。而伊邪那歧则针锋相对，发誓如果这样，那他每天必要产下一千五百人，从此兄妹二人反目成仇，不停互相诅咒憎恨。这一段故事让人想到希腊同样为了寻找死去爱人而到冥界的奥菲思，最后的结果也同样令人遗憾。而伊邪那歧之后的作为却令人不快，不由得同情伊邪那美。至于这两个神话的关系，照《古事记》成书的时期来看，当时的日本人似乎不具备剽窃希腊人神话的能力？可能是希腊人与日本人在关于死亡的态度有些相似之处，且可以发见一些日本人的地狱观。
在伊邪那歧狼狈回到生者之国后，由于伊邪那美尸体安葬在比婆山的缘故，且他自己也再没有胆量去接近伊邪那美的尸体，于是丧家犬一样叫嚣“出云是个污秽肮脏的鬼地方！”因为他之前接触了他现在认为污秽的伊邪那美，于是就远远的跑到日向去洗澡了。而他洗澡时，海水从他身上流下，这时又产生了诸多神明。且关于日本创世与之后历史来说非常重要几位神明与半神话人物也是此时诞生的。其中，最重要的三位为天照大神、月读命与须左之男。此三人都是抛弃了伊邪那美之后独身的伊邪那歧沐浴时产生的。在三人完全成长后，伊邪那歧命令天照大神治理高天原、月读命治理夜晚的世界、须左之男则去管理海界。由伊邪那歧对三人的任命来看，当时他在诸神中的地位已经相当高了。至少可以随意决定高天原的统治者。但是在伊邪那歧安排了三人管理的区域后，须左之男只是嚎啕大哭，没完没了。此举实在让人难以联想到他那满脸胡须，